利用samtools对参考基因组构建索引fai文件

Posted 小鲨鱼2018

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1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# ls Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# samtools faidx Arabido

以上是关于利用samtools对参考基因组构建索引fai文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

samtools建立fasta索引

区别samtools faid产生的.fai文件功能和bwa index 产生的四个文件的功能

2samtools-faidx index

sam文件转换为bam文件——SAMtools

samtools faidx 命令处理fasta序列

利用picard对参考基因组构建dict文件