#论文阅读&CTG Fetal Hypoxia Detection Based on Deep Convolutional Neural Network with Transfer Learn
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DOI | 10.1007/978-3-319-91186-1_25 |
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所属期刊 | CSOC2018 2018 |
论文发表时间 | 2018年05月17日 |
记录时间 | 2023年01月04日 |
记录人 | Troye Jcan |
Fetal Hypoxia Detection Based on Deep Convolutional Neural Network with Transfer Learning Approach
一、Datasets
CTU-UHB,552条数据,包括46例剖腹产和506例阴道分娩,以pH值≤7.05为病理(44例),pH值大于7.05为正常(508例),仅使用最后15min的信号。
仅使用FHR,没有添加UC信号和临床信息。
二、Data Processing
将FHR中的缺失段大于15s的片段删除,使用三次Hermite样条插值来修复较小的缺失段,之后在不损失可变性的情况下使用标准的中值滤波器来处理FHR。考虑到局部和全局的异常值,使用Romano提出的异常值检测算法(Outliers Detection and Processing in CTG Monitoring)。由于使用了非线性变换,因此去除了信号趋势(detrend the signal)以保留FHR的动态特性。
为了将信号转换为彩色光谱图图像以输入DCNN中,本文采用了极低频(very low frequency, VLF, 0-0.03Hz)、低频(low frequency, LF, 0.03-0.15Hz, 指向胎儿成熟)、中频(middle-frequency, 0.15-0.50Hz, 指向携带胎儿运动和母体呼吸的迹象)和高频(high frequency, HF, 0.50Hz-1Hz,受副交感神经系统波动的影响)的短时傅里叶变换(Short Time Fourier Transform, STFT),将FHR处理为四种不同频率的亚频率谱图。所得的亚谱图的shape为(675, 532, 3),resize为(227, 227, 3)后输入DCNN中。
本文使用CTU-UHB数据库,正常508例,病理44例。没有增加样本数量,没有说明数据集划分及数据量情况。
三、Model Framework
使用AlexNet的预训练模型作为模型框架,权重为使用120w张图像训练成的1000分类。模型包括五个卷积层、三个全连接层和部分ReLU层、Norm层和Pooling层。
微调AlexNet时,设置的超参数如下:
Parameter | Value |
---|---|
Mini batch size | 10 |
Maximum epoch | 4 |
learning rate | 0.0001 |
Validation frequency | 5 |
Optimizer | SGDM |
Optimizer momentum | 0.9 |
Optimizer weight decay | 0.0005 |
四、Methodology
本文提出一种基于深度卷积神经网络(Deep convolutional neural network, DCNN)的FHR信号的正常和异常分类方法。
五、Results
*Quality Index: Q I = S e n s i t i v i t y ∗ S p e c i f i c i t y QI= \\sqrtSensitivity * Specificity\\quad QI=Sensitivity∗Specificity
No. | Accuracy(%) | Sensitivity(%) | Specificity(%) | Quality index(%) | AUC | Training Time(s) |
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 92.12 | 53.84 | 95.39 | 71.67 | 0.81 | 38 |
2 | 96.34 | 53.84 | 100 | 73.38 | 0.84 | 48 |
3 | 96.97 | 69.23 | 99.34 | 82.93 | 0.93 | 45 |
4 | 96.36 | 69.23 | 98.68 | 82.65 | 0.86 | 52 |
5 | 93.33 | 53.84 | 96.71 | 72.16 | 0.83 | 37 |
6 | 90.9 | 53.84 | 94.07 | 71.17 | 0.76 | 35 |
7 | 92.72 | 15.38 | 99.34 | 39.09 | 0.78 | 38 |
8 | 95.75 | 53.84 | 99.34 | 73.13 | 0.86 | 36 |
9 | 81.81 | 69.23 | 82.89 | 75.75 | 0.82 | 18 |
10 | 96.97 | 69.23 | 99.34 | 82.93 | 0.91 | 80 |
Avg. | 93.32 | 56.15 | 96.51 | 72.48 | 0.84 | 42.7 |
六、Contributions
通过文献研究可以看到自动CTG分析的主要趋势依赖于一组构成预处理、特征变换(包括特征提取与特征选择)和分类的过程,而其中使用卷积神经网络来确定胎儿的不良结局的做法并不常见。综合《 The use of convolutional neural networks in biomedical data processing.》的94.1%准确率来看,使用DCNN是一种检测胎儿缺氧的有效工具。
七、Conclusion
根据实验结果,平均准确率、敏感性、特异性分别达到了93.32%、56.15%和96.51%。由于数据分布不平衡,特异性优于敏感性,因此QI和AUC更能体现不平衡的效果。平均QI和AUC分别为72.84%和0.84。因此,本文在DCNN检测胎儿缺氧方面取得了令人鼓舞的结果。
八、Note
整体框架:
如有问题,请及时反馈
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