R Markdown与RStudio IDE深度结合

Posted 2021-04-29 R语言中文社区

知乎专栏：

https://zhuanlan.zhihu.com/rstudio

The RStudio IDE 拥有非常多的独特设计，该设计能够方便编写执行交互式文档，本文介绍以下几点主要设计。

1. 文件样板

2. 使用 R Markdown

3. Markdown 快速指导

4. 执行按钮

5. 预览框

6. 文档选项

7. 插入代码块

8. 发布到http://shinyapps.io

9. R Markdown 控制台

如下图所示:

1. 文件模板

当你打开新的.Rmd文件时候， RStudio IDE 提供一个模板文件，打开新文件的“姿势”：File> New File > R Markdown.

打开后，将会弹出YAML帮助对话框：

在对话框中的侧边栏，可以选择.Rmd的输出类型，以下：

• Document - 静态文档

• Presentation - ioslides 或 beamer 幻灯片

• Shiny - 交互式文档

• From Template - 利用你曾经保存的模板类型

用复选框选择你想要的输出格式，选项功能与文件类型不同而不同。

你也可以通过代码窗口输出文件类型进行修改。

为了制作一个交互式文档，选在Shiny（侧边栏），选择 Shiny文档（复选框） ，ok！

RStudio将会打开一个新 .Rmd 文件，文件包含YAML内容，包括所有文件参数，当然你必须用正确的 rmarkdown::render()，你也可以后续手动修改参数。

RStudio将创建一个简单的模板范文，呈现少数基础的特性，那么，这就意味这你能立马执行这个文件，下图展示了交互式文件的模板。

2. 使用R Markdown

当你打开.Rmd文件，IDE在脚本框中有一个问号“？”，这个"?"可以打开下拉菜单，展现两个非常棒的教学资源。

“Using R Markdown,”选项打开R markdown网页 ：,rmarkdown.rstudio.com. 这里有功能介绍，随时可以查询。

3. Markdown Quick Reference

“Markdown Quick Reference,” 打开 markdown 语法向导，向导出现在帮助框。

向导用一个范例来展示markdown语法，在行文过程中，对照使用简介有效。

4. 执行命令按钮

如果.Rmd文件包含 runtime: shiny 在YAML 头条, RStudio IDE 将在脚本框中自动显示：“Run Document”。

“Run Document” 是rmarkdown::render 命令的快捷方式，能够快速执行渲染 .Rmd 文件，. The RStudio IDE执行结果将视窗展示。

同时你可以一边编辑 .Rmd文件一边预览结果， 保存文件可以看到最终结果，“refresh”功能早就为你准备好了。

如果 .Rmd文件不包含 runtime: shiny, RStudio IDE 将展示“Knit html” 按钮代替 “Run Document”， “Knit HTML”按钮有类似的功能，它 渲染文件并展示输出结果。

Knit HTML按钮有下拉菜单可以选择最终的输出结果的文件类型。

5. 预览框

默认RStudio IDE 会自动视窗展示Rmd文件的预览结果，不过，你可以选择输出场景，“View in Pane”在“Knit HTML”下拉菜单当中。

6. 文件选项

“Run Document” 右侧的工具选项能够自定义交互式文档，向导功能如下：

• 包含内容框

• 语法高亮

• bootstrap CSS 主题

• 自定义css

• 标题号

• 尺寸和添加题注的数字

• 调整呈现过程

RStudio IDE 将在点击 “Run Document”之后执行设定。

7. 插入组块

在脚本框的左上角，组块按钮的下拉菜单能够很好的帮助你管理你的文件。

第一个选项非常值得称赞，能够在光标为之插入一个代码块，在此基础上可以随意编写代码，

8. 发布到 http://shinyapps.io

如果安装了 shinyapps 包，详见（ Getting started with shinyapps.io, ），RStudio IDE 在交互式预览窗口的右上角有一个发布按钮，非常好用。

在网站发布之后，文档就有web的URL，可供其他人访问。

9. R Markdown控制台

一旦执行渲染 .Rmd文件，RStudio IDE 打开第二个控制台来展示输出，这个对话框不但展示执行过程，而且会提示代码错误，若是交互式文档，对话框将会提示对应的app的错误。

　 往期回顾 　

回复 爬虫            爬虫三大案例实战  
回复 Python       1小时破冰入门

回复 数据挖掘     R语言入门及数据挖掘
回复 人工智能     三个月入门人工智能
回复 数据分析师  数据分析师成长之路 
回复 机器学习      机器学习的商业应用
回复 数据科学      数据科学实战
回复 常用算法      常用数据挖掘算法