SPARK算例 | 从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用

Posted 2021-04-27 墨灵格信息科技

1H-吲唑-3-甲酰胺类化合物1是全新的ATP-竞争性GSK-3β抑制剂，它具有良好的激酶选择性、PK特性和药效，但其hERG抑制作用也很强。本文用Spark中的“docking”功能来快速识别化合物1双氟苯基片段的可替代R-基团，用于在靶标蛋白的未被占据的口袋中进行配体生长，以便发现那些现有起始化合物尚未与蛋白活性位点发生相互作用模式的新化合物。更具体地说，我们寻找与GSK-3 β 活性部位直接相互作用以增强GSK-3β活性的替代R-基团，以实现减少亲脂性、降低hERG抑制作用。详细内容，请点击阅读原文。