福利:测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班
Posted 胞外囊泡与外泌体
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了福利:测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
Exosome包含着各种蛋白质和核酸,诸如各种miRNA,其余为rRNA、lncRNA、DNA和其他RNA。近几年,由于miRNA、cirRNA、lncRNA等的深入研究,又大大提高了人们对外泌体RNA研究的热度。
所以,掌握芯片和数据挖掘套路对于外泌体研究,将是如虎添翼。平台又为大家找来了福利,2个免费学习的名额,价值2800元每位!
要点预览
第10期测序与芯片高通量数据挖掘与分析学习班
上海班:2019/1/12-13 (11号报到)
上海好望角饭店
通过该主题的学习,可以学会:
高通量公共数据的详细信息查找/下载;
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化。
学习班简介
高通量数据挖掘与分析是基于生信的方法从芯片及测序高通量数据中挖掘到与研究方向最相关的靶标基因(mRNA,miRNA,lncRNA或蛋白)。随着高通量手段的不断进步,测序和芯片的成本也逐渐降低,速度也越来越快,使用高通量手段(测序/芯片)进行科研的优点非常明显,也是大势所趋!
做过测序或者芯片实验的科研人员越来越多,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!我们也很难在大量的差异基因中筛选获得关键基因。因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
培训目的与培训预期
培训目的:
很多学员都做过测序或者芯片实验,虽然测序公司已经给出了一部分的数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键基因!
培训预期:通过2天的培训(半天理论课程+1天半实践操作),使学员掌握生信文献分析思路和8个实用操作知识点(具体见最后),可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。
培训时间与培训地点
培训时间:2019/1/12-13 (11号报到)
培训地点:上海好望角饭店 上海市徐汇区肇嘉浜路500号5楼会议室
学习班组织方
主办方:医药加科研培训中心
承办方:上海遐锦生物科技有限公司
讲师简介
宋伟博士
成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在上海、沈阳、济南、武汉等城市举办过十几场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《生信文章实例解读》、《生信与实验的密切关系》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《多组学整合分析流程》、《R语言培训》等
课程具体安排
课程安排:
1、理论课程:第一天上午
8.30-10:00第一节:基因数据库使用介绍
测序标准报告的解读。
NCBI Gene数据库:最权威的基因综合数据库之一。
NCBI GEO数据库: 数据量最大的高通量公共数据库。
GEO2R工具:在线做差异分析的R工具
bioDBnet:在线基因ID转换工具。
Uniprot: 最权威的蛋白综合数据库之一。
10.15-12:00第二节: DAVID工具——功能富集分析
功能富集的原理和意义
基因ID转换
基因功能注释(GO ,KEGG pathway)
基因功能富集(GO ,KEGG pathway)
基因功能聚类(GO ,KEGG pathway)
2、实践操作课程(共1天半)
第一天下午
13:30-17:30第三节 聚类热图及pathway map图
KEGG 数据库:最权威的通路数据库(pathway map 分析)
HEMI软件:构建聚类热图的本地软件
第二天上午
8:30-10:00第四节. STRING工具——基因/蛋白相互作用分析(PPI)
蛋白互作分析的原理和意义;
单个蛋白的蛋白互作分析;
多个蛋白的蛋白互作分析;
STRING工具的使用步骤:输入、参数设置、输出等。
10:15-12:00第五节 cytoscape网络做图软件(上)
网络图构建
逐个修改节点的属性和修改边的属性
网络展示方式layout更美观
网络统计分析
13:30-15:30第六节 cytoscape网络做图软件(下)
批量修改节点的属性和修改边的属性
Cytoscape的常用插件:ClusterONE
Cytoscape的常用插件:BinGO
15:30-17:00 答疑环节
通过该主题的学习,可以学会:
高通量公共数据的详细信息查找/下载;
在线做差异表达分析
在线blast分析
基因ID转换
通路map图制作
功能富集分析
蛋白互作分析
网络图的构建和美化。
学习费用
学习费2800元每位(学习费包含电子版教材、午餐,住宿费自理,保证学员完全掌握。)
优惠政策:
1. 提前支付转账的可提前拿到学习资料
2. 三人组团报名,每人收费2700元
3. 四人组团报名,每人收费2600元
4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册!
5. 参加过医药加TCGA/GEO数据挖掘的学员只要再支付1000元
可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。
注意事项:携带windows系统的电脑,苹果电脑请务必提前做好双系统。现场不得录音录像。
付款方式:
A单位转账:上海遐锦生物科技有限公司
账号:31050179400000001610
开户行:中国建设银行股份有限公司上海马陆支行
支付方式:
B支付宝账户
yonghong1028@126.com
实名:金永红(大金额转账时可能需要您补全全名)
C:现场刷卡
报名咨询与报名方式
报名咨询可联系 金老师 18917745941 王老师 13818765978
报名方式一:
报名方式二:邮件方式
为保证最快速的给您回复,请按下列格式撰写邮件发送到指定报名邮箱 :13818765978@163.com
报名邮件内容模板:(同期有其他会议举办,请不要省略所参加的是哪个会议)
测序与芯片的高通量数据挖掘与分析学习班(理论+实践课),以下是我的信息:
1、姓名:
2、性别:
3、邮箱:
4、手机:
5、参加场次:请写明参加期数 以及几月几日 北京还是上海的场次,以免弄错
6、发票抬头:如不确定,先留空。
7、纳税人识别号或统一社会信用代码:如不确定,先留空。
8、是否预订住宿:如需预订住宿请注明,一般默认住宿时间是从会议前一晚到会议最后一天中午退房,如果有特殊需要请注明。
9、备注:备注说明写在此,如有多人参加,请将姓名、性别、邮箱、手机在上面分别单独列出,备注中写明一位主要联系人。
住宿安排
住宿:(不强行规定,可自己预订附近其他酒店,费用自理)
经济大床/商务标间: 399元,490元/间/晚 (含早餐、含宽带)
近期医药加学习班安排如下,如需要报名,请加学习班秘书微信yiyaojia01
12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
12.15-16号 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
12.15-16 | 郑州新华建国饭店 | |
12.14-16 | 上海中兴和泰酒店 | |
12.15-16 | 上海中兴和泰酒店 | |
12.22-24 | 上海中兴和泰酒店 | |
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
1.5-6 | 北京金泰绿洲大酒店 | |
1.4-6 | 北京金泰绿洲大酒店 |
1.12-13 | 上海好望角饭店 | 第10期测序与芯片高通量数据挖掘学习班 |
1.12-13 | 上海好望角饭店 | 肠道菌群与代谢组学国自然课题设计及研究策略专题学习班 |
1.19-20 | 上海好望角饭店 | 第八期国自然基金标书构思与撰写冲刺班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰 | TCGA/GEO高通量数据挖掘学习班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰 | 第8期医学SCI论文写作及发表技巧学习班 |
1.19-20 | 上海中兴和泰 | 第28期非编码RNA与外泌体研究策略与基金申请学习班 |
重磅福利
两个免费名额(住宿费需自理)。
和其他学院享有同样的听课资料
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为保证公平公正
排名前10位的同学会被拉群发红包决出!
截止时间12月28号中午12点。
EVs-Exosomes由苏大,浙大, 法国居里研究所数位博士、博后及教授创建。
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