大数据时代下的育种数据 - 采管算
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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了大数据时代下的育种数据 - 采管算相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
来源｜百奥云
随着高通量自动化技术应用，育种将产生大量的表型和基因型数据，未来育种决策将越来越多的依赖数据分析，并减少对经验的依赖。对育种数据的管理会成为我国种业公司的新基建项目，而对数据的分析挖掘能力将成为育种核心竞争力。
百奥云立足育种的前沿领域，2018 年推出育种表型数据系统，2019年推出基于微信的田间采集小程序百奥e采。今天百奥云正式发布全新的基因型大数据系统，并升级表型数据分析系统和百奥e采。三款产品间的数据连通，形成了一套集育种数据采、管、算为一体的百奥云智能育种平台。
田间数据采集手工记录，方式落后，效率低。手工采集的方式，很难保证及时的数据汇总工作，增大了育种工作管理的难度。我国目前的育种工作，大多停留在田间手工记录在本子上的阶段，这就产生二次数据整理和录入工作易出错，数据整理工作量大，数据采集滞后等问题。甚至出现历史育种数据成为垃圾数据的糟糕局面。数据报不上来，数据分析利用，制订下一步育种计划都要受影响。因此，育种工作需要配备高效数据采集软件或设备。
百奥云开发的两款田间数据采集小程序百奥e采与百奥e采（高级版），实现了田间数据手机记录，一步实现数据
集中汇总。
1）
用户无需安装APP和其它育种软件，打开微信小程序就可以采集；
5）可实时校验汇总数据，采集完成后可立刻下载为Excel数据，防止数据丢失；
6）无需事先设置采集任务，可根据田间行列数临时生成，随时开始采集；
1）在基础版功能上实现与百奥云表型数据系统对接，采集任务自动下发，数据无缝传接；
2）数据也可上传至用户指定的服务器，数据存储无忧；
伴随高通量表现型分型技术和高通量基因分型技术的迅猛发展，对海量数据进行采集、加工处理、分析统计、可视化和最终应用于育种决策过程已经成为时代的标志，精准育种正式迎来了大数据时代。几千个育种材料，每个材料有上万个基因型位点，就是几千万到上亿条数据，不仅Excel处理不了，常用的关系型数据库也很难驾驭。没有先进的育种数据管理系统，很难实现现代商业育种。
百奥云智能育种系统中的表型数据管理模块，可通过Excel将记录的表型数据导入系统中，同时也可从指定的数据库系统自动获取数据，实现数据整合。
百奥云智能育种系统中的基因型数据管理模块，采用分布式数据库架构，可以轻松管理和可视化基因型数据。
数据快速积累的同时，如果没有大数据分析技术，数据将会变得十分庞大和复杂。数据本身并不能创造价值，只有通过有效的数据分析，为解析生物学数据与目标农艺性状的关系提供信息，才能帮助种育种家做出有效决策。现代育种技术体系复杂，需要多个学科交叉和多技术支撑。随着大量表型数据与基因型数据的积累，传统的数据分析模式已不能满足当下需求。百奥云开发的智能育种平台，涵盖了表型和基因型数据分析的常用功能。百奥云还可为用户提供定制化的全基因组预测和选择的分析服务。
表型数据分析功能中，不仅包含多种常规分析（如方差分析，回归分析，显著性分析等），还有深入分析功能。比如针对原始数据误差较大的问题，我们采用了空间校正的方法来减少环境不均一带来的误差。除空间校正外，还应用混合线性模型来估算品种的育种值，从而判断育种材料之间真正的遗传差异。还可以整合系统内多年的历史数据进行分析，对育种和决策比较有帮助。比如性状稳定性分析, 可用于比较两个品种在历年来的表现。也可进行区域适应性分析，对于品种定位非常有帮助。田间热力图，可用来直观展示试验田中不同小区之间产量的差异，从而反应出整块田的肥水管理是否均匀一致。这些分析模块是一般的育种软件所不具备的。分析结果以可视化的方式展示，同样的表格数据，我们会尽可能用图形来表达，例如柱形图、折线图、K线图、箱线图等。
百奥云表型数据系统的分析功能此前有过详细介绍，请点击进入百奥云公众号——左下角“产品服务”——“智能育种数据平台”查看。
基因型数据分析模块内置常用的基因型分析工具，如遗传距离计算、聚类分析、群体结构分析、PCA分析，基因型比较等等，用户只要点击几下鼠标就可以轻松完成专业的基因型数据分析工作，辅之以可视化图形展示，结果一目了然。
百奥云的育种软件系列产品已在隆平高科、湖南杂交水稻研究中心、河北农科院等几十家育种企业和科研单位使用。百奥云领先的设计、完善的功能、易用的界面和贴心的服务，受到了用户的广泛好评。此次百奥云发布智能育种平台，将育种数据采集和管理及基因型与表型数据的分析融为一体，在智能育种的道路上迈出了坚实的一步。
地址：湖南省长沙市岳麓区高新区麓谷大道658号麓谷信息港A座
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