如何利用现有的R语言代码和数据快速发表SCI文章线上班 8月1-2日线上
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赠送全程视频供复习使用 建群答疑学员问题
1,R语言已经成为众多临床医生分析临床大数据和生物医学大数据的首选软件,很多好的学习班一旦涉及到R语言我一头雾水咋办
2,网上下载的那些破代码压根不能使用(也许我不会)
3,我没有数据,也不知道如何下载和分析,论文咋办?
4,好不容易得到测序数据,公司的报告看不懂,聚类分析,富集分析还是不会做
5,想用 R 语言分析GEO和 TCGA 数据、单细胞测序数据,肠道菌群数据作生信分析,但是不知道如何入手
1,特别适合R语言小白,很多小白想参加涉及到R语言的学习班就懵了。因为没有R语言基础,网上下载的代码又无法使用,因此常常会陷于无法继续学习而放弃的困境。本班特地花一天的时间普及学员需要用到的R语言知识,给您以后学习其他的课程打下坚实的基础(给您录播,让您慢慢的复习)。
2,本课程的代码和案例数据都是老师精心整理的,简单易学,独家所有,不是从网上下载的哦。
3,无论您有没有数据都没有关系,我们给您提供了每一种数据挖掘方法对应的案例数据。您如果收集了自己的数据可以按照案例数据的格式整理数据,直接应用代码并替换成自己的数据即可完成数据挖掘分析。如果您没有数据,我们可以告知您从公共数据库中如何获得数据,并应用代码一步一步傻瓜式操作完成数据挖掘过程。
4,本课程内容覆盖面广,含复杂生物医学数据分析、深层次数据挖掘及图表的可视化,案例讲解详细,实操性强。
本讲座将以案例形式详细讲解如何应用R软件完成生物医学数据挖掘分析,涉及的数据挖掘方法均为当前较为热门的分析算法,包括决策树和随机森林分类器的构建、指标和样本的聚类与分类、各种热图的绘制以及临床和公共数据库的基因组数据挖掘等。讲座还将分享如何应用R语言整合基因组与临床数据快速发表SCI论文的经验。
授课老师
H教授,擅长统计研究设计、各类型数据统计分析、生物医学大数据挖掘及生物信息学分析等。主持和参与多项国家级、省部级和局级科研课题。
内容安排
时间 |
培训内容 |
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8月1日 上午 (9:00- 12:00) |
R语言基础操作(一) |
1.R软件(R和Rstudio)以及R软件包的下载与安装 2.R语言基础操作(数据集的创建、导入、向量运算、矩阵运算) 3. R语言条件语句与循环语句 4.R语言数据管理(数据匹配、缺失值处理等) 5. R软件常用统计分析(数据描述、统计检验、线性回归等) |
8月1日 下午 (14:00- 17:00) |
R语言基础操作(二) |
1. R软件统计学分析的批处理 2.R软件的图表绘制 3.基于ggplot2的R软件绘图 4. 生物医学数据挖掘的概念与简介 |
8月2日 上午 (9:00- 12:00) |
基于R软件的数据挖掘-复杂医学统计模型分析 |
1. Logistic回归及Cox回归分析:列线图和校准图的绘制 2. 模型评价:C统计量及NRI与IDI的计算 3. 决策曲线分析 4. 竞争风险的生存分析 5.案例论文讲解 |
基于R软件的数据挖掘-聚类与分类 |
1.聚类的概念及常用聚类方法(K均值聚类与系统聚类)的R软件实现及可视化 2.双向聚类热图的绘制 3.分类的概念,性能及评估 4.决策树与随机森林分类器的构建及R软件实现和可视化 5.主成分分析及应用主成分分析绘制分类图 6.案例论文讲解 |
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8月2日 下午 (14:00- 17:00)
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基于R软件数据挖掘—关联规则 |
1.关联规则的概念 2.关联规则的概念及常用关联规则分析方法(Apriori算法) 3.关联规则分析的R软件实现及可视化 4.案例论文讲解 |
基于R软件的生物信息学分析—基因组数据挖掘R软件包CancerSubtypes |
1.数据导入及数据预处理(数据正态化,数据的缺失值填补) 2.聚类热图的绘制,差异表达基因提取,绘制火山图 3.肿瘤亚型比较,绘制亚型聚类热图和Silhouette图 4. GO和KEGG富集分析及图形绘制 5. 基于GEO和TCGA公共数据库挖掘的论文写作与发表 |
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基于R软件的生物信息学分析 —肠道菌群与单细胞测序的相关数据分析 |
1.基于R软件的肠道菌群相关数据分析及案例论文讲解 2.基于R软件的单细胞测序数据分析及案例论文讲解 |
2020年8月1日-2日 线上授课
3200元/人。
可开会务、试剂检测、分析服务等发票,可回放
报名付费成功后,提前发培训需要应用到的软件与课件,并且指导安装。
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