一周内教会您用R语言挖掘公共数据库（TCGAGEO）发表文章 9月21-25日 线上班

Posted 2021-04-18 玮瑜科研平台

每晚三个小时、边学边消化

现场完成一篇文章的流程以及所有图表，

全程实战，全程讲解代码，全部是自己的文章无限回放，

建群完善更好的售后服务

2020年9月21-25日  （线上授课 互动性强）

课程简介

没有经费做课题，没有实验造图形？聪明人必须学着绕过去，

我们不需要经费，完全不需要实验。

用R语言挖掘公共数据，发表SCI文章

R语言是科研工作者必备技能。本次以一篇SCI全文复现为目的，不瞎学R，用R解决科学问题，用R去发现新的临床问题。

学习目标

根据自己的专业，找到课题、挖掘机制、锁定标记物

基金中呈现漂亮的图表和前期基础

掌握R语言处理GEO，TCGA数据的所有核心技能

科研绘图的所有技能

课程特色

全程实战，全程讲解代码，全是自己文章，重点讲解关键步骤，

更多的售后服务，更好的掌握所有技能。

最大胆、最全面、最深入人心地直达灵魂地讲解。

至少2个套路的全程实战，让你快速掌握数据挖掘套路。

现场完成一篇文章的流程以及所有图表。

授课老师

猴哥：武汉大学博士，副主任医师，讲师，发表SCI论文25篇，历任3家公司数据分析师，100篇meta分析数据分析经验，43场公益讲座授课基础，5年免费答疑的耐心和责任心。主持国家自然科学基金1项，主持省级课题3项、湖北陈孝平科技发展基金会肝胆胰恶性肿瘤研究基金1项、国家级大学生创新创业训练计划项目3项。 

课程安排

日期	主题	主要培训内容
第一天晚上 7:00-10:00	R语言实战入门 R安装 Rstudio安装 3小时掌握R语言	菜鸟如何学习R 语言 R语言数据构成和流程控制 如何用好for循环和apply家族函数 如何转换为可以直接套用代码的数据（数据调整） 猴哥文章中的数据清洗和整理 R语言统计和作图简介 R语言无障碍安装和调用 R语言导入和导出
第二天晚上 7:00-10:00	R语言模块化技能	GEO数据库从下载、整理、分析、出图、涵义（清除无意义的数据，发表级的热图，最漂亮的火山图，GO分析，KEGG分析，共表达网络）、GEO数据便捷实用的GSEA分析，GEO芯片的探针的注释
第三天晚上 7:00-10:00	全代码实战猴哥芯片meta分析核心部分 11分的文章实例解析生信联合实验套路 Sun M. Integrated analysis identifies microRNA-195 as a suppressor of Hippo-YAP pathway in colorectal cancer. Journal of Hematology & Oncology. 2017. 10(1):79 (IF=11.059, PMID: 28356122)	芯片数据的检索、下载、预处理 猴哥多个GEO芯片联合分析（芯片meta）简介和制作 GEO芯片的探针转化为基因名的N种方法 R语言数据框的调整（掌握tidyr和dplyr） GE）芯片的差异分析、GO、KEGG、GSEA等 学员练习 （线上指导、配给视频练习）
第四天晚上 7:00-10:00	全代码复现生存相关signature文章核心部分 （A prognostic 4-gene expression signature for patients with HER2-negative breast cancer receiving taxane and anthracycline-based chemotherapy，Oncotarget, 2017）	GEO数据下载    TCGA数据下载 生存相关signature的筛选和降维(lasso模型和rubust模型等) 批量生存分析 单因素生存分析 多因素生存分析 全代码制图 全代码制表 发表级图表的排版
第五天晚上 7:00-10:00	TCGA ceRNA文章发表和制作 Sun M. a comprehensive study based on weighted gene co-expression network analysis and competing endogenous RNA network. Breast Cancer Res Treat. (IF 3.626, PMID: 30715658)	TCGA数据下载和数据库找课题 提取mRNA、IncRNA、MiRNA矩阵 ceRNA网络构建 批量生存分析、单因素、多因素、制表、制图 批量GO、KEGG 实战讲解猴哥例文

【主办单位】

玮瑜科研平台

【承办单位】

上海玮瑜生物科技有限公司

上海焦务科技服务中心

【注册费用】

3200元/人。

可开会务费 注册费 试剂检测费  分析服务费等

线下班开班可以零差价免费学

【时间地点】

会务时间：2020年9月21日-25日   线上班

【汇款账号】

A：汇款账户

账户名称：上海焦务科技服务中心  

账 户 号：9734 0078 8012 0000 0311

开 户 行：上海浦东发展银行大华支行 

B：支付宝转账

收款人：[e-mail]   支付宝户名:上海玮瑜生物科技有限公司

【联系人】

联系人：谢老师 13611825136     

报名邮箱： [e-mail]

【报名方法】

报名方法一：邮箱报名：您编辑您的姓名、手机号码 参加班级发送到[e-mail]邮箱

报名方法二：在线报名：

其他课程安排，关注平台点击近期会议

8.29-30	线上	肠道菌与代谢研究思路与课题设计在线班
8.29-30	线上	CRISPR/Cas9基因组编辑技术(动植物、斑马鱼)
9.14-18	线上	单细胞测序数据挖掘与分析和课题设计
9.12-13	线上	Meta分析与网状meta分析
9.12-13	线上	影像组学应用与SCI论文写作线上会议
9.19-20	线上	临床医生如何利用tcga与seer等数据库发文章
9.19-20	线上	网络药理学、分子对接和生物信息学技术研究中药复方或单体
9.19-20	线上	2021年国自然基金前期准备及标书撰写经验线上分享会
9.21-25	线上	R语言挖掘公共数据库（TCGA、GEO）发表文章