手把手教分析| 掌握R语言第一步

Posted 2021-04-18 TBM学院

R

语言在统计学等领域被广泛的应用。它是一款集成了数据操作、统计，以及可视化功能的免费开源软件。尤其在生物信息学领域，R语言可是必备的交互工具。对于非专业的人士，R语言软件的下载和R包的安装是运用R语言的重要步骤。

让我们从头开始，学会怎么安装R/Rstudio以及R包。

R和Rstudio的安装

R语言下载网址：

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

Rstudio下载网址：

https://rstudio.com/products/rstudio/download/

按照默认的选项安装，尽量不要安装到有中文名称的路径下。

RStudio 功能强大，但只是辅助使用 R 的一个工具，安装使用RStudio 之前需要事先安装好 R。

R包的安装

安装好R语言之后，下面介绍安装R包的几个方法：

01

通过命令行下载R包

(1)install.packages("BiocManager"),选择China对应的镜像

(2)BiocManager::install("pheatmap"),使用该命令前先安装好BiocManager包

02

通过官网手动下载和安装R包

使用R语言官网或者bioconductor官网下载R包。

(1)R语言官网:

https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

选择左边的Packages,随后选择Table of available packages, sorted by name或者Table of available packages, sorted by date of publication,查找需要安装的R包并下载,详见图。

(2)bioconductor:

http://www.bioconductor.org/

下载好对应的R包之后,打开R语言,选择程序包,点击加载本地的R包,选择已经下好的R包压缩文件,即可安装R包。

最后一步，检查R包是否安装成功．运行library(‘XX’),如library(‘pheatmap’)

没有出错，即R包安装成功。

RRstudio软件和R包的安装就介绍到这，下期内容将讲述如何利用R语言绘图，精彩内容不要错过。

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