生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班通知(10月9-11日)
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2017年10月9-11日,北京微生太科技有限公司将联合北京市计算中心等7家单位,推出生物信息数据处理与Perl语言编程应用专题培训班。
参加该研讨班的学员投稿《中国生物工程杂志》,通过审稿的论文将会优先发表;参加该研讨班的学员将获得价值1000元的微生太代金券,可以用于抵扣在北京微生太科技有限公司进行的测序分析项目的项目款或下次参加培训班的学费,2018年12月31日前有效。
培训班具体信息
主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会
承办单位:北京市计算中心
协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室
中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会
北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心
中国生物工程杂志
北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司
北京微生太科技有限公司
培训地点:北京海淀区丰贤中路7号3号楼,北京市计算中心三楼会议室
培训日期:2017年10月9-11日(报名中)
课程时间:上午:9:30-12:00;下午:13:30-17:00
课程安排:
日期 |
授课题目 |
授课内容 |
第一天 |
概述 |
1. 生物信息学数据处理概述; 2. Perl语言简介特点与数据处理的优势与应用范围。 |
运行调试 |
1. Perl语言解释器、编辑器安装; 2. Perl运行环境测试与程序编写; 3. UltraEdit软件应用与生物信息学数据文件处理; 4. 基于宏的perl语言快速编程。 |
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操作基础 |
1. Perl语言基本变量、操作符、判断结构;循环结构; 2. Perl语言常用函数的功能应用; 3. 生物学数据文件的读入与输出; 4. 生物信息学常见文件的分割、合并、过滤、信息提取等; 5. 批量自动化数据文件操作。 |
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第二天 |
生物信息实例应用 |
1. 常用生物信息学数据文件格式简介; 2. 用perl从NCBI、ENA等数据库批量下载基因序列; 3. 用perl进行生物学数据文件格式转化; 4. 用perl编程从Fasta、GBK、Fastq、PDB等提取关键生物学数据信息; 5. 用perl批量自动化下载基因序列; 6. 用perl进行DNA到protein批量翻译; 7. 用perl批量DNA序列反向互补。 |
高级数据处理 |
1. Perl语言的数组、二维数组、hash表用法; 2. 用perl自动化从表格数据提取信息; 3. 矩阵数据文件的生成与应用; 4. 二代测序NGS、GWAS等生物信息分析中perl的应用。 |
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第三天 |
模块与子程序 |
1. perl子程序与模块应用; 2. 强大的正则表达式的应用; 3. 用perl进行基因ID列表比较、筛选与统计。 |
Perl的高级应用 |
1. Perl第三方代码库CPAN的简介与应用; 2. Bioperl模块与应用; 3. 常用生物信息学程序实例; 4. 用perl进行批量自动化本地blast比对及数据分析; 5. 基于perl的circos基因组作图工具介绍。 |
(课程内容可能有微调,以实际授课为准)
【培训特色】
1、对口生物信息;
2、非严格语法,适合初学;
3、功能强大、跨平台;
4、有巨大的第三方代码库CPAN。
【报名费用】
注册费:3800元/人(含听课费、资料费、上机费和午餐费,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。
【报名优惠政策】
1、9.10日前预报名的学员每人可优惠200元;
2、3人以上团体报名每人可减少400元;
3、5人团报,负责团报者可以获得一个免费培训名额;
4、上面4种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。
成功报名以收到学员培训费为准,培训座位按收到费用先后顺序安排。
【报名方式】
【付费方式】
现金、银行转账、银行汇款、刷卡均可;
收款单位全称:北京市计算中心;账号:0200151819100023937 ;
开户银行:中国工商银行股份有限公司北京永丰支行
(汇款信息里备注上:“生物计算事业部——您的姓名”,个人汇款请同时备注单位名称)
【住宿推荐】
培训地点附近500米处有如家酒店(永丰店),010-56760899,可以自行预定,费用自理。
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