利用Perl提取TCGA临床数据
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篇首语：本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理，主要介绍了利用Perl提取TCGA临床数据相关的知识，希望对你有一定的参考价值。
之前有人问我如何提取TCGA临床数据，今天在这里讲解一下。
第一步，下载TCGA的jison文件，电脑安装好Perl
第二步，将jison文件和Perl脚本放在同一个文件
第三步，在所在文件目录，单击鼠标右键，点击“在此处打开命令窗口（W）”，进入dos
第四步，输入命令：perl extract_clinical_data metadata.cart.2017-12-26T09-08-49.492693, 按回车，得到my_data.txt
以上是关于利用Perl提取TCGA临床数据的主要内容，如果未能解决你的问题，请参考以下文章
不用学编程搞定TCGA肿瘤临床数据，利用tablea读取json
我们也要开班讲临床医生的数据挖掘了（R,GEO,TCGA）。
Education：TCGA及SEER公共数据库挖掘与应用学习班