新品发布 | 百奥智汇推出一站式单细胞数据分析软件-OmniAnalyzer

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2021年8月3日,百奥智汇发布首款一站式单细胞数据分析软件OmniAnalyzer。该软件内置多种算法,包含从原始数据处理、批次效应校正到细胞分群、细胞类型识别、差异表达分析、轨迹推断等全套数据分析流程,无需任何代码编程,在普通电脑点击按钮即可高效完成各项分析,拿到可发表的数据图表。

自2009年问世以来, 单细胞技术在解析细胞异质性、探索疾病发生发展机制等基础研究中大放异彩,在临床中的应用前景也初见端倪。
目前,虽然单细胞实验设备的商业化已十分成熟,但系统性的单细胞数据分析与深度挖掘仍是摆在科研人员面前的一个难题。对于一个完整的课题研究来说,从完成单细胞实验到获得下机数据,才仅仅完成整个课题需求的一小部分,后续的数据分析往往才是困扰科研人员的关键点。对数据的精准分析和深度挖掘有助于将实验数据的价值最大化,揭示更多对课题研究有价值的信息,进而有效指导后续的功能实验及临床验证,助力生物医学的发展和进步。
为帮助更多科研人员解决单细胞数据分析与深度挖掘这一难题,百奥智汇特推出一站式单细胞数据分析软件-OmniAnalyzer,打破了以往数据分析需要很高的生信技术门槛的限制。利用OmniAnalyzer软件,用户只需在图形界面设置参数,动动鼠标即可轻松完成单细胞数据分析的全部流程。

软件详情

1. 产品优势

首创 :国内首款本地单细胞数据分析软件
高效 :内置多种算法,高效完成各功能模块运算处理
灵活 :各分析模块内部参数均可灵活调整
安全 :本地电脑实现数据分析,不上传数据,保证数据安全
无门槛 :无需生信基础,使用普通电脑,点击按钮即可轻松操作
一站式 :从原始下机数据处理到终端数据分析的一站式解决方案
多组学 :兼容单细胞转录组、免疫组库、表面蛋白、空间转录组等多组学数据
可发表 :数据图表参数灵活调整,可直接导出用于文章发表

软件联用:可与OmniBrowser联动使用,便于单细胞大数据管理与挖掘


2. 功能介绍

完整分析流程:支持降维、聚类、注释、差异表达、轨迹推断等通用分析流程

多组学支持:支持单细胞转录组、免疫组库、表面蛋白、空间转录组等多组学数据

多种格式支持:支持mtx/h5ad等多种格式表达矩阵;支持fastq原始数据处理

自定义预处理:用户可自选参数进行细胞/基因过滤、标准化及批次效应校正

图1. OmniAnalyzer数据分析路线。


3. 结果展示

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(1) Batch Removal

不同样本的单细胞测序数据之间可能会因为实验、测序、人员等多种因素产生批次效应,批次效应的存在很可能会掩盖科学问题的真实情况。 因此,在数据分析过程中,准确识别样本间的批次效应并进行校正对整个研究至关重要。
为了解决此问题,OmniAnalyzer内置Harmony和Pegasus两种算法可帮助研究者进行批次效应校正;同时,OmniAnalyzer还提供直接整合多个样本的选项,研究者可先通过直接整合后的分析结果评估是否需要进行批次效应校正。  
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图2. 批次效应校正。

(2) 细胞分群与细胞类型注释

细胞分群模块中,OmniAnalyzer提供多种降维方法和聚类方法供研究者选择,且内置SciBet、Pegasus等算法,可帮助研究者针对细胞分群结果进行细胞类型注释,如图3。  
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图3. 细胞分群与细胞类型注释。 

(3) 差异表达基因分析

对细胞分群结果进行差异表达基因分析时,OmniAnalyzer提供多种差异基因、特征基因可视化展示方式供研究者选择,如图4。  
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图4. 差异表达基因热图、小提琴图、箱线图。

(4) 轨迹推断

根据细胞分群等结果,用户可选择感兴趣的亚群进行轨迹推断分析,得到发育轨迹线,如图5,预测亚群间的状态变化关系,指导后续的其他分析及功能实验等。
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图5. 轨迹推断。

讲座预告与福利放送

百奥智汇将于2021年8月5日(星期四)下午2点-3点,举办OmniAnalyzer新品线上发布会,通过本次发布会,您将了解到以下内容:
1. OmniAnalyzer产品优势
2. OmniAnalyzer功能详细介绍
3. OmniAnalyzer应用与分析结果展示
请扫描下方二维码注册参与,报名成功并全程参与线上发布会,即有机会获得OmniAnalyzer新产品试用机会,感受新产品的魅力!敬请期待!

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关于百奥智汇

百奥智汇是一家生命科学技术公司,致力于将单细胞机理研究平台和生物信息学大数据/AI平台充分应用于癌症等重大人类疾病的诊断和治疗。通过创建人类疾病的精准细胞图谱,充分利用自身强大的科研能力、自有平台和数据,百奥智汇将寻找具突破性的疾病诊断和治疗靶标、开发颠覆性的治疗方法。

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