数据分析系列 之python语言中的聚类分析

Posted 琅晓琳

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了数据分析系列 之python语言中的聚类分析相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

1 基础算法
(1) K-means算法:对于给定的样本集,按照样本之间的距离大小,将样本集划分为K个簇。让簇内的点尽量紧密的连在一起,而让簇间的距离尽量的大。
(2) K-means算法是局部最优解,初始聚类中心一般是随机选择,有可能运行两次的结果稍有不同。
(3) 距离公式常采用欧式距离和余弦相似度公式,前者越小代表距离越小,后者越大代表越相似。

2 算法实现

import numpy as np
from scipy.cluster.vq import * vq,kmeans,whiten
listA=[86.0,72.0,94.0,83.0]
listB=[89.0,85.0,97.0,93.0]
listC=[86.0,76.0,96.0,82.0]
data=np.array([listA,listB,listC])
whiten=whiten(data)
#kmeans功能是对数据进行聚类,2代表类别,返回结果是元组
#A,_表示只需要取元组的第一个内容
centroids,_=kmeans(whiten,2)
#vq是矢量量化函数
result,_=vq(whiten,centroids)
print(result)

3 scikit learn工具包解决方法

import numpy as np
from sklearn.cluster import KMeans
from scipy.spatial.distance import cdist
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn import datasets
listA=[86.0,72.0,94.0,83.0]
listB=[89.0,85.0,97.0,93.0]
listC=[86.0,76.0,96.0,82.0]
X=np.array([listA,listB,listC])
#fit是一个训练过程
kmeans=KMeans(n_clusters=2).fit(X)
#predict是一个预测过程
pred=kmeans.predict(X)
print(pred)

#注意聚类和分类的区别
#直观理解起来就是:聚类是无标签的,分类是有标签的
#以下为分类的示例,利用SVM算法
from sklearn import datasets
from sklearn import svm
clf=svm.SVC(gamma=0.001,C=100.)
digits=datasets.load_digits()
#fit方法学习,data[:-1]从位置0到位置-1之前的数
clf.fit(digit.data[:-1],digits.target[:-1])
#predict方法预测,data[-1]最后一个位置的数
result=clf.predict(digit.data[-1])
print(result)

4 模型的选择和评估
“肘”方法:绘制出K值和SSE(误差平方和)的对应关系,找到趋于平缓的位置K值即为最佳聚类数。

参考资料:
https://www.icourse163.org/learn/NJU-1001571005?tid=1463102441&from=study#/learn/content?type=detail&id=1240380198&sm=1 用python玩转数据

以上是关于数据分析系列 之python语言中的聚类分析的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

R语言聚类分析之基于划分的聚类KMeans实战:基于葡萄酒数据

不用苦苦寻找,这就是最全的聚类算法汇总(附Python代码演示)

R语言层次聚类(hierarchical clustering):特征缩放抽取hclust中的聚类簇(cutree函数从hclust对象中提取每个聚类簇的成员)基于主成分分析的进行聚类结果可视化

关于k-means算法的聚类分析

python数据分析-聚类分析(转载)

R中的聚类分析:确定最佳聚类数