小猢狲肿瘤药物推荐系统

Posted 2021-05-01 王居其一

一哥最近开始投入肿瘤治疗的研究中。昨日天降灵感，今天靠积累了二十年的技术手段，6小时完成一个作品：小猢狲肿瘤药物推荐系统。

事情要从几年前IBM说起。IBM出了一个AI叫Watson（沃森），据说达到了肿瘤医生的水平，但是后来不知怎么了没声音了。咱的水平当然和IBM不能比啦，我们的国产版叫小猢狲。在上海话中，念xiao whe‎ssen

小猢狲的功能是用户输入病情相关的三个关键单词，单词的内容任意。比如可以输入癌的名称+突变基因+突变位点，或者癌的名称+突变基因+转移，等等。当然也可以是其他相关的词，很自由，唯一的要求是必须三个单词。AI接受输入后从最新的癌症药物中生成一个推荐列表。推荐的依据是海量的文献报道和基于自然语言处理(NLP)+深度神经网络的AI。

OK，不看广告看疗效。我们来测试一下这个系统吧。

首先要测试的是我去年侥幸治好的一例结直肠癌转卵巢癌的病人。当时开刀医生已经放弃了，但是正好被我找到一篇论文，针对病人的基因突变精准下药（西妥昔单抗），现在病人在上班了。该病人是CRC（结直肠癌）+TP53突变+APC突变。我们看小猢狲的推荐:

可以看到，小猢狲推荐三种主要方案：5_fu化疗，奥沙利铂化疗和西妥昔单抗靶向治疗。因为一哥还不是肿瘤专家，前面两种方案效果如何并不清楚，但是西妥昔单抗疗法排在第三，而且得分和其他两种方案接近，说明系统是靠谱的。

假设系统是靠谱的，我们来放飞一下，看看其他的假想肿瘤和突变如何治疗比较好。如果有相关专家看到有所不妥，还请指正。

例子一：如果膀胱癌+FGFR3突变+TP53突变。小猢狲推荐顺铂化，同时也提到了阿霉素治疗。

例子二：在非小细胞肺癌中假设看到了KRAS基因的G12C该怎么办？小猢狲提到了吉非替尼和顺铂两种方案。其中粗略文献搜索表明吉非替尼方案有存在可能性。

例子三：这是真实例子，在三阴乳腺癌中看到BARD1突变，而且已经转移。小猢狲推荐了顺铂化疗和紫杉醇两种方案。

综上所述，小猢狲系统可以初步实现肿瘤药物的精准推荐，理论上说还存在AI泛化推荐文献未广泛报道的药物的可能性。目前该系统暂时作为“冷门绝学”（文科据说流行这个词）留在我这里进一步试验，目标是真正协助医生看好病，而非发论文。