R语言利用caret包比较ROC曲线

Posted 2023-04-22

R语言利用caret包比较ROC曲线我们之前探讨了多种算法，每种算法都有优缺点，因而当我们针对具体问题去判断选择那种算法时，必须对不同的预

参考技术A R语言利用caret包比较ROC曲线
我们之前探讨了多种算法，每种算法都有优缺点，因而当我们针对具体问题去判断选择那种算法时，必须对不同的预测模型进行重做评估。为了简化这个过程，我们使用caret包来生成并比较不同的模型与性能。
操作
加载对应的包与将训练控制算法设置为10折交叉验证，重复次数为3：
library(ROCR)
library(e1071)
library("pROC")
library(caret)
library("pROC")
control = trainControl(method = "repaetedcv",
number = 10,
repeats =3,
classProbs = TRUE,
summaryFunction = twoClassSummary)

使用glm在训练数据集上训练一个分类器

glm.model = train(churn ~ .,
data= trainset,
method = "glm",
metric = "ROC",
trControl = control)
使用svm在训练数据集上训练一个分类器

svm.model = train(churn ~ .,
data= trainset,
method = "svmRadial",
metric = "ROC",
trControl = control)
使用rpart函数查看rpart在训练数据集上的运行情况

rpart.model = train(churn ~ .,
data = trainset,
method = "svmRadial",
metric = "ROC",
trControl = control)
使用不同的已经训练好的数据分类预测：

glm.probs = predict(glm.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")
svm.probs = predict(svm.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")
rpart.probs = predict(rpart.model,testset[,!names(testset) %in% c("churn")],type = "prob")
生成每个模型的ROC曲线，将它们绘制在一个图中：

glm.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],
predictor = glm.probs$yes,
levels = levels(testset[,c("churn")]))
plot(glm.ROC,type = "S",col = "red")

svm.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],
predictor = svm.probs$yes,
levels = levels(testset[,c("churn")]))
plot(svm.ROC,add = TRUE,col = "green")

rpart.ROC = roc(response = testset[,c("churn")],
predictor = rpart.probs$yes,
levels = levels(testset[,c("churn")]))
plot(rpart.ROC,add = TRUE,col = "blue")
三种分类器的ROC曲线
说明将不同的分类模型的ROC曲线绘制在同一个图中进行比较，设置训练过程的控制参数为重复三次的10折交叉验证，模型性能的评估参数为twoClassSummary,然后在使用glm,svm,rpart,三种不同的方法建立分类模型。
从图中可以看出，svm对训练集的预测结果（未调优）是三种分类算法里最好的。

R语言deLong‘s test：使用自定义函数检验两个ROC曲线的差异是否具有统计显著性比较两个或多个相关ROC曲线的AUC的非参数检验

R语言deLong\'s test：使用自定义函数检验两个ROC曲线的差异是否具有统计显著性、比较两个或多个相关ROC曲线的AUC的非参数检验

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