做过DNA,基因,序列分析之类的请进!
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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了做过DNA,基因,序列分析之类的请进!相关的知识,希望对你有一定的参考价值。
几个问题请教:第一,都需要分析什么内容,方法是什么?我目前知道的有blast同源序列。但是听别人说还要找什么开放阅读框,外显子的,怎么找啊。具体点哈!网站上有的颜色不知道表示什么含义,郁闷。第二,还有什么需要分析的?第三,我还知道好像要设计引物什么的,干嘛用的啊?我的序列已经已知了啊。第四,整个流程该是怎样的,有范例么?要从得到序列之后的,不要如何得到序列的方法的(比如双脱氧云云)。最好留下Q请教,本人初涉分子,有好的参考书籍也欢迎推荐。感激不尽。。
第一,都需要分析什么内容,方法是什么?分析的内容很多,看有无突变,编码区的序列编码什么蛋白,非编码区的可能调控机制等等。有了序列才可以做下一步的工作。
我目前知道的有blast同源序列。但是听别人说还要找什么开放阅读框,外显子的,怎么找啊。具体点哈!网站上有的颜色不知道表示什么含义,郁闷。
UCSC genome browser (http://genome.ucsc.edu/ )是一个很好的看外显子的网站,外显子都用黑色的块表示。
第二,还有什么需要分析的?
太多了,看你需要干什么。比如要克隆,链接等,就要看有无限制性酶切位点等等。
第三,我还知道好像要设计引物什么的,干嘛用的啊?我的序列已经已知了啊。
引物是做PCR,或者继续测序用的。
第四,整个流程该是怎样的,有范例么?要从得到序列之后的,不要如何得到序列的方法的(比如双脱氧云云)。最好留下Q请教,本人,有好的参考书籍也欢迎推荐。感激不尽。。
《分子克隆》是一本很好的入门书,不过既然初涉分子,一切还是慢慢来,问题要一个一个问,这样才能懂。最好是实验时遇到了问题,再来问我,这样就一个例子来教你,效果比较好。 如果你是研究生水平,那最好。本科也没有问题。 参考技术A hhh666
DNA序列分析的内容及代表性分析工具。
DNA序列比对 blast 限制性酶切位点分析Bioedit ORF分析ORF Finder
蛋白质序列分析的内容及代表性分析工具。
蛋白质理化性质分析ProtParam 蛋白质的亲疏水性protscale 蛋白质二级结构预测PredictProtein 蛋白质跨膜区预测TMpred TMHMM 信号肽预测SignalP 卷曲螺旋coils
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