sh 测试参考基因组在wormbase上是否发生了变化;在WS245和WS261之间,没有任何改变!

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wget ftp://ftp.wormbase.org/pub/wormbase/releases/WS245/species/c_elegans/PRJNA13758/c_elegans.PRJNA13758.WS245.genomic.fa.gz
wget ftp://ftp.wormbase.org/pub/wormbase/releases/WS261/species/c_elegans/PRJNA13758/c_elegans.PRJNA13758.WS261.genomic.fa.gz
zcat c_elegans.PRJNA13758.WS245.genomic.fa.gz | tr '[:upper:]' '[:lower:]' | tr -d '\n' | md5sum
zcat c_elegans.PRJNA13758.WS261.genomic.fa.gz | tr '[:upper:]' '[:lower:]' | tr -d '\n' | md5sum

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sh 下载Wormbase Genomes并为bwa,blast等设置#fasta

python 获取wormbase菌株信息#wormbase

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