是否可以在删除节点的同时在 networkX 中为图形设置动画?

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【中文标题】是否可以在删除节点的同时在 networkX 中为图形设置动画?【英文标题】:Is it possible to animate a graph in networkX while removing nodes? 【发布时间】:2020-02-21 21:48:03 【问题描述】:

我有一个由大约 200 个节点组成的图,我在每次迭代中删除其中的节点。 可以在删除节点的情况下可视化图形,但这样做时节点的位置不会改变。理想情况下,我想移除节点,看看剩余的节点是否靠得更近,以及随着越来越多的节点被移除,集群是否会形成。

我为此使用 networkX。我试图在每次迭代时重新计算图形,但图形的创建方式似乎存在一些随机性。因此,每次迭代我都会得到一个非常不同的图表。

有没有办法实现我想要的?

【问题讨论】:

【参考方案1】:

您可以为此使用draw_networkx

import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt

nodes = [i for i in range(10)]
edges = [(i, i+1) for i in range(5)]
G = nx.Graph()
G.add_nodes_from(nodes)
G.add_edges_from(edges)

positions = 

for node in nodes:
    positions[node] = (node, node)

nx.draw_networkx(G, pos=positions)

我生成一个带有一些边的 10 个节点的图,然后定义一个 dict,其中键是节点(这里是 1 到 10),值是 (x,y) 格式的坐标。在此示例中,我将节点沿一条线排列。 然后,在下一次迭代中,只需删除不需要的节点并传递相同的 dict。它会跳过丢失的节点,只绘制图中仍然存在的节点:

G.remove_nodes_from([5,6])
nx.draw_networkx(G, pos=positions)

您应该会看到节点 5 和 6 丢失。 .draw_networkx 依赖于 matplotlib,因此您可以执行该库允许的许多事情。更多信息here。

希望对你有帮助!

【讨论】:

以上是关于是否可以在删除节点的同时在 networkX 中为图形设置动画?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

NetworkX节点属性绘制

是否可以使用 Networkx 和 Python 根据节点属性获取度中心性值?

减少networkx中图的节点/边数

networkx 算法中是不是有一个函数可以返回我指定的某些节点周围的集团/集群/组件?

以编程方式在 networkx 的 pygraphviz/dot 包装器中指定相同等级的节点

当networkx中有数百个节点时如何避免重叠?