R语言DESeq2基因差异表达分析

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篇首语:本文由小常识网(cha138.com)小编为大家整理,主要介绍了R语言DESeq2基因差异表达分析相关的知识,希望对你有一定的参考价值。

参考技术A

经过表达定量后,我们已经得到了基因的表达量矩阵,差异表达分析通常是RNA-seq分析的第一步。

差异基因表达分析通常都是在R中,常用的有DESeq2,edgeR,limma等几种,这次主要介绍用DESeq2来进行差异表达分析。

需要准备的数据:基因表达定量矩阵(counts)及分组文件

安装

使用

以上是关于R语言DESeq2基因差异表达分析的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

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