fastqc linux 下安装完成后运行提示如下,请高手帮忙看看,谢谢……
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Can't exec "java": 没有那个文件或目录 at /usr/bin/fastqc line 183.
我也遇到了这个问题 需要你安装java 这是我的:~$ java -version
程序 'java' 已包含在下列软件包中:
* default-jre
* gcj-4.9-jre-headless
* openjdk-7-jre-headless
* gcj-4.8-jre-headless
* openjdk-6-jre-headless
* openjdk-8-jre-headless
请尝试:sudo apt-get install <选定的软件包>
:~$ sudo apt-get install openjdk-8-jre-headless
[sudo] password for yaochaogang:
E: 无法获得锁 /var/lib/dpkg/lock - open (11: 资源暂时不可用)(我的遇到这个问题 )
E: 无法锁定管理目录(/var/lib/dpkg/),是否有其他进程正占用它?
:~$ sudo rm /var/cache/apt/archives/lock
:~$ sudo rm /var/lib/dpkg/lock
:~$ sudo apt-get install openjdk-8-jre-headless
。。。
需要下载 63.2 MB 的软件包。
解压缩后会消耗掉 276 MB 的额外空间。
您希望继续执行吗? [Y/n] y
就这样 就可以使用fastqc了 希望对楼主有用! 参考技术A 提醒的意思是说,没有安装java,所以没法运行fastqc,fastqc是基于java环境的。所以你需要安装java,步骤如下:
1.在官网下载的x64的压缩包,2.百度下怎么安装和配置环境变量,3.然后终端输入java -version,获得版本信息,安装成功~~ 参考技术B 我也遇到这问题,java也装了,环境变量也改了,就是不行,不过fastqc是perl 写的,找到报错这行,把$java_bin 强制改为java的绝对路径就行了,以后有啥问题再说吧,烦
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