使用 ggplot2 在 R 中保持一致的图形大小(图例和轴改变大小)

Posted

技术标签:

【中文标题】使用 ggplot2 在 R 中保持一致的图形大小(图例和轴改变大小)【英文标题】:Consistent graph size in R using ggplot2 (legend and axis change the size) 【发布时间】:2012-09-23 09:14:15 【问题描述】:

我有一个主要是外观问题。我正在使用 ggplot2 库创建四个图,然后将它们排列在一列中(使用this)。这些图表显示相同的数据,但对于四组,x 轴是时间,这就是为什么我要将图表保留在一个列中。

所以我将图例添加到顶部图表,并将 x 轴的标签添加到底部图表。这两个动作改变了图表的大小;添加图例会导致图表增长,添加 x 轴标签会导致图表缩小以适应这些内容。

有没有办法指定固定的图形大小,使我的布局保持一致?

我的情节:

可重现结果的代码:

library(ggplot2)
library(reshape)

raw_data <- structure(list(Sample = c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 9L, 
10L, 11L, 12L, 13L, 14L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L, 20L, 21L, 22L, 
23L, 24L, 25L, 26L, 1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 6L, 7L, 8L, 9L, 10L, 
11L, 12L, 13L, 14L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L, 20L, 21L, 22L, 23L, 
24L, 25L, 26L), Month = structure(c(12L, 12L, 11L, 11L, 10L, 
10L, 3L, 3L, 5L, 5L, 4L, 4L, 8L, 8L, 1L, 1L, 9L, 9L, 7L, 7L, 
6L, 6L, 2L, 2L, 12L, 12L, 12L, 12L, 11L, 11L, 10L, 10L, 3L, 3L, 
5L, 5L, 4L, 4L, 8L, 8L, 1L, 1L, 9L, 9L, 7L, 7L, 6L, 6L, 2L, 2L, 
12L, 12L), .Label = c("April", "Aug", "Dec", "Feb", "Jan", "July", 
"June", "March", "May", "Nov", "Oct", "Sep"), class = "factor"), 
    Channel = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
    2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("A", 
    "B"), class = "factor"), Amplitude = c(5000L, 
    5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 
    5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 
    5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 
    5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L, 5000L)), .Names = c("Sample", 
"Month", "Channel", "Amplitude"), row.names = c(NA, 52L), class = "data.frame")



multiplot <- function(..., plotlist=NULL, cols) 
    require(grid)

    # Make a list from the ... arguments and plotlist
    plots <- c(list(...), plotlist)

    numPlots = length(plots)

    # Make the panel
    plotCols = cols                          # Number of columns of plots
    plotRows = ceiling(numPlots/plotCols) # Number of rows needed, calculated from # of cols

    # Set up the page
    grid.newpage()
    pushViewport(viewport(layout = grid.layout(plotRows, plotCols)))
    vplayout <- function(x, y) 
            viewport(layout.pos.row = x, layout.pos.col = y)
    

    # Make each plot, in the correct location
    for (i in 1:numPlots) 
        curRow = ceiling(i/plotCols)
        curCol = (i-1) %% plotCols + 1
        print(plots[[i]], vp = vplayout(curRow, curCol))
    




mybarplot <- function(first=0, last=0) 
    # Create the barplot 
    p <- ggplot(raw_data, aes(x=Sample, y=Amplitude, fill=Channel))

    # Make it a grouped barplot with already summarised values
    p <- p +  geom_bar(position="dodge", stat="identity")


    # Apply a log10 transformation to the y-axis, and create appropriate axis ticks
    p <- p + scale_y_log10(breaks = c(5,10,50,100,500,1000,5000,10000))

    # Zoom in (barplots will not show when axis change to remove 0, so have to zoom)
    p <- p + coord_cartesian(ylim=c(1,15000), xlim=c(1,26))

    # Make it greyscale
    p <- p + scale_fill_grey()


    # Hide X label
    p <- p + opts(axis.text.x=theme_blank(), axis.title.x=theme_blank(), axis.title.y=theme_blank())
    # Change X label size
    p <- p + opts(axis.text.y=theme_text(size=7))



    # Change the Legend
    p <- p + scale_fill_manual(values=c("black", "grey75", "grey25"), name="Channel", breaks=c("A", "B"))

    #margins
    # c(top,,bottom,)
    top_margin    <- unit(c(    1, 1, -0.25, 1), "lines")
    middle_margin <- unit(c(-0.25, 1, -0.25, 1), "lines")
    bottom_margin <- unit(c(-0.25, 1,     2, 1), "lines")


    if (first) 
        # Anchor legend box to top right corner
        p <- p + opts(legend.justification=c(1,1), legend.position=c(1,1))
        # Put a white box around it
        p <- p + opts(legend.background = theme_rect(fill="white"))
        # Top margin
        p <- p + opts(plot.margin = top_margin)
        p <- p + scale_x_discrete(breaks = 1:26)
     else 
        p <- p + opts(legend.position="none")
        if (last) 
            # Bottom margin
            p <- p + opts(plot.margin = bottom_margin)
                # label X-axis
            p <- p + scale_x_discrete(breaks = 1:26, labels=c("Sep", "", "Oct", "", "Nov", "", "Dec", "", "Jan", "", "Feb", "", "March", "", "April", "", "May", "", "June", "", "July", "", "Aug", "", "Sep", ""))

            p <- p + ylab("Amplitude")
            p <- p + xlab("Sampling time")
            # Angle x labels
            #p <- p + opts(axis.text.x=theme_text(angle=-45, hjust=0.5))
            p <- p + opts(axis.text.x=theme_text(hjust=0.5))

            # Move X title
            p <- p + opts(axis.title.x=theme_text(vjust=-0.5))
         else 
            p <- p + opts(plot.margin = middle_margin)
            p <- p + scale_x_discrete(breaks = 1:26)
        
    






plot1 <- mybarplot(first=1)
plot2 <- mybarplot()
plot3 <- mybarplot()
plot4 <- mybarplot(last=1)

multiplot(plot1, plot2, plot3, plot4, cols=1)

会话信息:

> sessionInfo()
R version 2.15.1 (2012-06-22)
Platform: x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)

locale:
[1] C

attached base packages:
[1] grid      stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] reshape_0.8.4 plyr_1.7.1    ggplot2_0.9.1

loaded via a namespace (and not attached):
 [1] MASS_7.3-18        RColorBrewer_1.0-5 colorspace_1.1-1   dichromat_1.2-4    digest_0.5.2       labeling_0.1       memoise_0.1        munsell_0.3        proto_0.3-9.2      reshape2_1.2.1    
[11] scales_0.2.1       stringr_0.6.1     

【问题讨论】:

你能显示你用来制作情节的代码,以便你的问题是reproducible。 很抱歉。添加了重现它的代码。 【参考方案1】:

在您的示例中,每个情节都是相同的,但我认为这不是您最终产品的计划。我认为最简单的方法是分面,而不是单独布置每个情节。

dat <- data.frame(facetvar=letters[1:5], yvar=rep(1:10, each=5), xvar=rep(letters[6:10], each=5))
ggplot(dat, aes(x=xvar, y=yvar, group=facetvar)) + 
    geom_bar(stat='identity') + 
    facet_grid(facetvar~.)

如果需要,您可以先对数据进行子集化,然后使用任意分面变量。

ggplot(dat[sample(1:50, 40),], aes(x=xvar, y=yvar, group=facetvar)) + 
    geom_bar(stat='identity') + 
    facet_grid(facetvar~.)

如果需要,您还可以将scales.y='free' 提供给facet_grid()

【讨论】:

是的,我的示例中的数据相同,但不会出现在最终图表中。那只是因为它是复制它的最快方法。大小差异仍然存在。为了使用构面,我需要将所有数据放在 1 帧中,对吗?现在我从 4 个单独的文件中获取数据,我需要先转置和融合数据。我明天会在工作中考虑这样做,但我担心将它们整合到一个数据框中会很棘手。 你是对的,你需要一个data.frame。然而,在你的融化步骤之后,你通常可以添加一个任意的“facet”列并使用rbind()之类的东西将它们混合在一起。 应该一点也不难。将四个数据集中的响应列和预测列重命名为相同的值,为每个列添加一个提供 facet id 的列(通过rep(ID, length(data)),绑定它们,然后使用 facet 语句重新绘制 谢谢,它似乎工作。这样就解决了。只需要弄清楚一些小事让它看起来不错。

以上是关于使用 ggplot2 在 R 中保持一致的图形大小(图例和轴改变大小)的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

如何使用 ggplot2 在 R 中制作具有透明背景的图形?

无论 x 标签如何,都保持绘图的大小,无论有多少条,都保持条的大小

R语言ggplot2可视化指定保存到pdf的图像的具体尺寸保证缩放的一致性:使得绘图元素(文本点大小等)在设计上都具有相同的绝对大小设置全局数据点大小主题格式设置图像保存的具体尺寸

在 R 中使用 ggplot2 复制图形

ggplot2超详细讲解

自动调整 ggplot 中条形图的大小,以实现多个图形 R 的一致性