热图与 matplotlib 使用 matshow
Posted
技术标签:
【中文标题】热图与 matplotlib 使用 matshow【英文标题】:Heatmap with matplotlib using matshow 【发布时间】:2014-02-26 11:42:04 【问题描述】:我正在尝试生成 10x10 矩阵的热图。矩阵中的所有值都是概率;所有元素的总和等于 1.0。我决定使用 matshow 绘图类型(它看起来很容易使用),但是到目前为止我无法生成我想要的输出。
1.视觉上看起来有点丑。你会推荐一个适合用于热图的颜色图吗?
2.有没有办法在使用 matshow 时将预定义的 bin 分配给颜色图?例如。采用 1000 种颜色的渐变,始终为相应的概率使用相同的颜色。在默认行为中,我认为 matshow 检查最小值和最大值,将渐变中的第一个和最后一个颜色分配给这些值,然后通过插值对它们之间的值进行着色。
有时我在矩阵中有非常相似的概率,而其他时候概率的范围可能很大。由于我在上面试图解释的默认行为,我得到了类似的图,这使得比较更加困难。
顺便说一下,我用于生成上述热图(和示例图)的代码如下。
谢谢!
import numpy as np
import matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt
def pickcoord():
i = np.random.randint(0,10)
j = np.random.randint(0,10)
return [i,j]
board = np.zeros((10,10))
for i in range(1000000):
try:
direction = np.random.randint(0,2)
new_board = np.zeros((10,10))
coords = pickcoord()
if direction == 1:
for k in range(2):
new_board[coords[0]][coords[1]+k] = 1
else:
for k in range(2):
new_board[coords[0]+k][coords[1]] = 1
except IndexError:
new_board = np.zeros((10,10))
board = board + new_board
board_prob = board/np.sum(board)
plt.figure(figsize=(6,6))
plt.matshow(board_prob, cmap=matplotlib.cm.Spectral_r, interpolation='none')
plt.xticks(np.arange(0.5,10.5), [])
plt.yticks(np.arange(0.5,10.5), [])
plt.grid()
【问题讨论】:
【参考方案1】:您的第二个问题可以使用matshow
函数的vmin
和vmax
参数来解决:
matshow(board_prob, cmap=cm.Spectral_r, interpolation='none', vmin=0, vmax=1)
考虑到您的第一个问题,这取决于您要强调或显示的内容。从default colormaps of matplotlib 中选择合适的颜色图。
【讨论】:
以上是关于热图与 matplotlib 使用 matshow的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
如何为 matplotlib.pyplot.matshow 绘图添加标签和标题