从 Python 3.1.1 到 R 的最佳接口是啥？

Posted 2023-02-22

【中文标题】从 Python 3.1.1 到 R 的最佳接口是啥？

【英文标题】：What is the best interface from Python 3.1.1 to R?从 Python 3.1.1 到 R 的最佳接口是什么？

【发布时间】：2011-02-04 02:43:01

【问题描述】：

我在 Mac OS X 10.6.2 上使用 Python 3.1.1，需要一个 R 接口。在浏览互联网时，我发现了 RPy。这是正确的选择吗？

目前，Python 中的程序计算距离矩阵并将其存储在文件中。我以交互方式单独调用 R 并读取矩阵进行聚类分析。为了 简化计算可以为 R 准备一个脚本文件，然后从 Python 调用它并读回结果。由于我是 Python 新手，我不想回到 2.6。

【问题讨论】：

不幸的是，据我所知，rpy，甚至 rpy2，都不支持 Python 3。 Python 3 很简洁，但如果你需要大量的第三方库，你最好暂时坚持使用 Python 2。

【参考方案1】：

编辑：重写以总结随着时间积累的编辑。

当前的 rpy2 版本（2.3.x 系列）完全支持 Python 3.3，而 没有关于 Python 3.0、3.1 或 3.2 的声明。 在撰写下一个 rpy2 版本（正在开发中，2.4.x 系列）时，仅支持 Python 3.3。

Python 3 支持历史：

rpy2-2.1.0-dev / Python 3 存储库中的分支 - 实验 支持和应用 Google Summer of Code 项目，包括将 rpy2 移植到 Python 3（在 Python伞）

应用程序被接受，并且由于 Google 对 Python 3 的资金支持慢慢进入了主代码库（在 GSoC 之后还有相当多的工作要做 - 它适用于分支 version_2.2.x )。

【参考方案2】：

PypeR 如果您尝试将 R 与最新版本的 Python（如 3.1）一起使用，这是一个选项

更多信息请访问：

http://rinpy.sourceforge.net/

【参考方案3】：

我认为 Python 3.1.1 没有任何可用选项。

R-Python 绑定的当前状态：

目前，三个选项：RPy、RPy2 和RSPython。

RPy 和 RPy2 由同一个开发团队开发和维护； RPy2 是对 RPy 的重大重写（它又基于 Omega hat 的 RSPython）。

RPy 仍在积极维护中。

RSPython 仍然可用，但我相信它不再积极开发。几个月前我看了看，我能找到的最新版本 (0.7-1) 于 2006 年 10 月发布。

RPy2 的最新稳定版本和开发版本（2.1 rc）针对 R 版本 2.10（当前稳定版本）和 Python 版本 2.6（即使用的版本）进行了优化开发中）。我不知道 RPy2 开发人员宣布支持 Python 3.x 版。

【讨论】：

似乎还有第四个选项可用：PypeR [sourceforge.net/projects/rinpy/files and jstatsoft.org/v35/c02/paper]