使用 Stargazer 包按类别变量获取单独的汇总统计

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【中文标题】使用 Stargazer 包按类别变量获取单独的汇总统计【英文标题】:Obtaining Separate Summary Statistics by Categorical Variable with Stargazer Package 【发布时间】:2014-10-12 22:09:51 【问题描述】:

我想使用stargazer 为分组变量的每个类别生成汇总统计信息。我可以在单独的表格中完成,但我希望将所有内容合二为一——如果这对这个包来说不是不合理的挑战的话。

例如

library(stargazer)
stargazer(ToothGrowth, type = "text")
#> 
#> =========================================
#> Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
#> -----------------------------------------
#> len       60 18.813  7.649   4.200 33.900
#> dose      60 1.167   0.629   0.500 2.000 
#> -----------------------------------------

ToothGrowth 中的 continue 变量提供汇总统计信息。我想用分类变量supp 来拆分这个摘要,也可以在ToothGrowth 中。

关于期望结果的两个建议

stargazer(ToothGrowth ~ supp, type = "text")
#> 
#> ==================================================
#> Statistic         N   Mean   St. Dev.  Min   Max  
#> --------------------------------------------------
#> OJ       len       30 16.963  8.266   4.200 33.900
#>          dose      30  1.167  0.634   0.500  2.000
#> VC       len       30 20.663  6.606   8.200 30.900
#>          dose      30  1.167  0.634   0.500  2.000 
#> --------------------------------------------------
#> 
 stargazer(ToothGrowth ~ supp, type = "text")
#> 
#> ==================================================
#> Statistic          N   Mean   St. Dev.  Min   Max  
#> --------------------------------------------------
#> len               
#>        _by VC     30 16.963  8.266   4.200 33.900
#>        _by VC     30  1.167  0.634   0.500  2.000
#> _tot              60 18.813  7.649   4.200 33.900
#> 
#> dose             
#>        _by OJ     30 20.663  6.606   8.200 30.900
#>        _by OJ     30  1.167  0.634   0.500  2.000 
#> _tot              60 1.167   0.629   0.500 2.000         
#> --------------------------------------------------

【问题讨论】:

该死,我刚刚在 Google 上搜索了“stargazer 分类变量摘要”,这是第一次点击。 我很欣赏你的问题,并对其进行了赏金以得到更多关注。我想知道您是否自己找到了一个好的解决方案和/或当前的任何回复是否回答了您的问题? 我相信您的赏金似乎有效,以下答案符合我的要求?我想当我最初问这个问题时,我觉得答案并不完全符合我的需求。 【参考方案1】:
invisible(lapply(levels(ToothGrowth$supp),stargazer))

会,但如果你想在两者之间单独的 \subsection,你可能应该使用类似的东西

invisible(lapply(levels(ToothGrowth$supp),function(sg)
    cat("\\subsectionadd your text here\n")
    print(stargazer(sg)
  )

【讨论】:

嗯……谢谢!如果我想更改 stargazer() 函数中的各种可能参数怎么办? 只需将其添加到 stargazer(sg) 调用中即可。 感谢您的帮助。我真正想要的是一个带有由分类变量分隔的汇总统计信息的表,而不是创建单独的表。不确定观星者是否有这种能力。 @DieterMenne,我喜欢你的解决方案的简单性。我想知道您是否有兴趣根据上面迈克尔的评论添加您的答案?【参考方案2】:

三种可能的解决方案。一个使用reporttools 和xtable,一个使用tidyverse 工具和stargazer,第三个使用base-r 解决方案。

首先,

我想建议你看看reporttools,这有点离开stargazer,但我认为你应该看看它,

# install.packages("reporttools")  #Use this to install it, do this only once
require(reporttools)

vars <- ToothGrowth[,c('len','dose')]
group <- ToothGrowth[,c('supp')]

## display default statistics, only use a subset of observations, grouped analysis
tableContinuous(vars = vars, group = group, prec = 1, cap = "Table of 'len','dose' by 'supp' ", lab = "tab: descr stat")

% latex table generated in R 3.3.3 by xtable 1.8-2 package
\begingroup\footnotesize
\beginlongtablellrrrrrrrrrr
 \textbfVariable & \textbfLevels & $\mathbfn$ & \textbfMin & $\mathbfq_1$ & $\mathbf\widetildex$ & $\mathbf\barx$ & $\mathbfq_3$ & \textbfMax & $\mathbfs$ & \textbfIQR & \textbf\#NA \\ 
  \hline
len & OJ & 30 & 8.2 & 15.5 & 22.7 & 20.7 & 25.7 & 30.9 & 6.6 & 10.2 & 0 \\ 
   & VC & 30 & 4.2 & 11.2 & 16.5 & 17.0 & 23.1 & 33.9 & 8.3 & 11.9 & 0 \\ 
   \hline
 & all & 60 & 4.2 & 13.1 & 19.2 & 18.8 & 25.3 & 33.9 & 7.6 & 12.2 & 0 \\ 
   \hline
dose & OJ & 30 & 0.5 &  0.5 &  1.0 &  1.2 &  2.0 &  2.0 & 0.6 &  1.5 & 0 \\ 
   & VC & 30 & 0.5 &  0.5 &  1.0 &  1.2 &  2.0 &  2.0 & 0.6 &  1.5 & 0 \\ 
   \hline
 & all & 60 & 0.5 &  0.5 &  1.0 &  1.2 &  2.0 &  2.0 & 0.6 &  1.5 & 0 \\ 
   \hline
\hline
\captionTable of 'len','dose' by 'supp'  
\labeltab: descr stat
\endlongtable
\endgroup

在乳胶中你会得到这个很好的结果,

第二,

使用tidyverse 工具和stargazer、inspired by this SO answer、

# install.packages(c("tidyverse"), dependencies = TRUE)
library(dplyr); library(purrr)
#> ToothGrowth %>% split(. $supp) %>% walk(~ stargazer(., type = "text"))
#> =========================================
#> Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
#> -----------------------------------------
#> len       30 20.663  6.606   8.200 30.900
#> dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 
#> -----------------------------------------
#> =========================================
#> Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
#> -----------------------------------------
#> len       30 16.963  8.266   4.200 33.900
#> dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 
#> -----------------------------------------
#> 

第三,

独家base-r

by(ToothGrowth, ToothGrowth$supp, stargazer, type = 'text')
    #> =========================================
    #> Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
    #> -----------------------------------------
    #> len       30 20.663  6.606   8.200 30.900
    #> dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 
    #> -----------------------------------------
    #> 
    #> =========================================
    #> Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
    #> -----------------------------------------
    #> len       30 16.963  8.266   4.200 33.900
    #> dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 
    #> -----------------------------------------
    #> ToothGrowth$supp: OJ
    #> [1] ""                                         
    #> [2] "========================================="
    #> [3] "Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  "
    #> [4] "-----------------------------------------"
    #> [5] "len       30 20.663  6.606   8.200 30.900"
    #> [6] "dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 "
    #> [7] "-----------------------------------------"
    #> --------------------------------------------------------------- 
    #> ToothGrowth$supp: VC
    #> [1] ""                                         
    #> [2] "========================================="
    #> [3] "Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  "
    #> [4] "-----------------------------------------"
    #> [5] "len       30 16.963  8.266   4.200 33.900"
    #> [6] "dose      30 1.167   0.634   0.500 2.000 "
    #> [7] "-----------------------------------------"

【讨论】:

【参考方案3】:

解决方案

library(stargazer)
library(dplyr)
library(tidyr)

ToothGrowth %>%
    group_by(supp) %>%
    mutate(id = 1:n()) %>%
    ungroup() %>%
    gather(temp, val, len, dose) %>%
    unite(temp1, supp, temp, sep = '_') %>%
    spread(temp1, val) %>%
    select(-id) %>%
    as.data.frame() %>%
    stargazer(type = 'text')

结果

=========================================
Statistic N   Mean  St. Dev.  Min   Max  
-----------------------------------------
OJ_dose   30 1.167   0.634   0.500 2.000 
OJ_len    30 20.663  6.606   8.200 30.900
VC_dose   30 1.167   0.634   0.500 2.000 
VC_len    30 16.963  8.266   4.200 33.900
-----------------------------------------

说明

这消除了 OP 在对原始答案的评论中提到的问题,“我真正想要的是一个带有由分类变量分隔的汇总统计信息的单个表,而不是创建单独的表。”我看到使用stargazer 做到这一点的最简单方法是使用gather()unite()spread() 策略创建一个新数据框,其中包含每个组的观察变量。唯一的技巧是通过按组创建唯一标识符并在调用 stargazer() 之前删除该变量来避免重复标识符。

【讨论】:

【参考方案4】:

您可以简单地将 subset 与 stargazer 一起使用。 *另外,请确保您的数据是使用 as.data.frame 的数据框,以便 stargazer 生成输出。

library(stargazer)
# Descriptive statistics for Income of Org 1
stargazer(subset(mydata, mydata$org==1),
title="Income for Org 1", type = "html", out="stat_org1.html")

【讨论】:

以上是关于使用 Stargazer 包按类别变量获取单独的汇总统计的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

jitwatch查看JIT后的汇编码

Stargazer 中的集群稳健标准误差

r 使用stargazer包创建摘要统计信息

在 stargazer 中计算偏度和峰度

Stargazer和gam - 如何包含整个摘要输出?

使用 dplyr 包按时间平均 - R