Fortran 重塑 - N 维转置
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【中文标题】Fortran 重塑 - N 维转置【英文标题】:Fortran reshape - N-dimensional transpose 【发布时间】:2016-09-23 08:46:12 【问题描述】:我正在尝试在 Fortran 中编写一些需要重新排序 n 维数组的代码。我认为 reshape 内在函数结合 order
参数应该允许这样做,但是我遇到了困难。
考虑以下最小示例
program test
implicit none
real, dimension(:,:,:,:,:), allocatable :: matA, matB
integer, parameter :: n1=3, n2=5, n3=7, n4=11, n5=13
integer :: i1, i2, i3, i4, i5
allocate(matA(n1,n2,n3,n4,n5)) !Source array
allocate(matB(n3,n2,n4,n1,n5)) !Reshaped array
!Populate matA
do i5=1, n5
do i4=1, n4
do i3=1, n3
do i2=1, n2
do i1=1, n1
matA(i1,i2,i3,i4,i5) = i1+i2*10+i3*100+i4*10000+i5*1000000
enddo
enddo
enddo
enddo
enddo
print*,"Ad1 : ",matA(:,1,1,1,1),shape(matA)
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [3,2,4,1,5])
print*,"Bd4 : ",matB(1,1,1,:,1),shape(matB) !Leading dimension of A is the fourth dimension of B
end program test
我希望这会导致
Ad1 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 3 5 7 11 13
Bd4 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 7 5 11 3 13
但我发现:
Ad1 : 1010111.00 1010112.00 1010113.00 3 5 7 11 13
Bd4 : 1010111.00 1010442.00 1020123.00 7 5 11 3 13
我已经用gfortran
(4.8.3 和 4.9)和ifort
(11.0)尝试了这个并找到了相同的结果,所以我很可能只是误解了 reshape 的工作原理。
任何人都可以阐明我的问题所在以及如何实现我的目标吗?
【问题讨论】:
您可能想要matB
的第三列,所以也许您只是没有在正确的点使用逆排列? [我认为这是你的问题,但这当然会改变你所期望的答案的其他方面。]
【参考方案1】:
当在reshape
中指定order=
时,以置换下标顺序获取的结果的元素对应于源数组的元素。这可能并不完全清楚。 Fortran 2008 标准将其声明为(忽略关于pad=
的部分)
结果的元素,按照置换的下标顺序 ORDER (1), ..., ORDER (n),是 SOURCE 的正常数组元素顺序的元素..
这意味着从您的 order=[3,2,4,1,5]
示例中可以映射到
matA(1,1,1,1,1), matA(2,1,1,1,1), matA(3,1,1,1,1), matA(1,2,1,1,1), ...
的
matB(1,1,1,1,1), matB(1,1,2,1,1), matB(1,1,3,1,1), matB(1,1,4,1,1), ...
matB
的第三个索引中偏移量变化最快,对应于matA
的第一个索引中变化最快。 matB
中的下一个最快变化是维度 2,然后是维度 4,依此类推。
所以,是元素 matB(1,1,1:3,1,1)
对应于 matA(:,1,1,1,1)
。
我已经明确了matB
切片的范围,因为您对matB
的形状有疑问:您希望matB
的形状与@ 给出的排列相反987654335@ 说明符。
你可以把你的例子写成
implicit none
integer, parameter :: n1=3, n2=5, n3=7, n4=11, n5=13
integer matA(n1,n2,n3,n4,n5)
integer matB(n4,n2,n1,n3,n5) ! Inverse of permutation (3 2 4 1 5)
integer i1, i2, i3, i4, i5
forall (i1=1:n1, i2=1:n2, i3=1:n3, i4=1:n4, i5=1:n5) &
matA(i1,i2,i3,i4,i5)=i1+i2*10+i3*100+i4*10000+i5*1000000
print*,"Ad1 : ",matA(:,1,1,1,1),shape(matA)
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [3,2,4,1,5])
print*,"Bd3 : ",matB(1,1,:,1,1),shape(matB)
end
或者,如果你想要的是matB
的形状,那么它就是想要反转的顺序排列:
matB = reshape(matA, shape(matB), order = [4,2,1,3,5])
乍一看,查看与源尺寸相关的顺序可能很自然。但是,以下可能会澄清:无论源的形状如何,重塑的结果都是相同的(使用的是自然顺序的数组元素); order=
值的大小等于 shape=
值的大小。对于其中的第一个,如果源是 [1,2,3,4,5,6]
(回想一下我们如何构造 rank-2 数组),那么 order=
如果用于来源。
【讨论】:
非常感谢,它澄清了order
的工作。我已经阅读了规范,但我认为这是阅读我期望看到的内容而不是它实际所说的内容。这意味着如果我们有N=reshape(M,shape(N),order=[a,b,c])
,那么M
的第一个维度将成为N
等的ath 维度。
很自然地期望顺序是源的尺寸。但是,也许以下内容可能有助于改变这种直觉(或提醒):无论源的形状如何,重塑的结果都是相同的(使用的是自然顺序的数组元素); order=
值的大小等于 shape=
值的大小。对于其中的第一个,如果源是 [1,2,3,4,5,6]
(召回二维数组的构造),那么如果在源上使用 order=
将永远不会有任何效果(它必须是 [1]
) .
这确实有助于我的理解,再次感谢您。【参考方案2】:
因为我也觉得order
对多维数组的行为很不直观,所以我在下面做了一些代码比较以使情况更加清楚(除了已经完整的@francescalus 的答案)。首先,在一个简单的例子中,reshape()
有和没有order
给出以下结果:
mat = reshape( [1,2,3,4,5,6,7,8], [2,4] )
=> [ 1 3 5 7 ;
2 4 6 8 ]
mat = reshape( [1,2,3,4,5,6,7,8], [2,4], order=[2,1] )
=> [ 1 2 3 4 ;
5 6 7 8 ]
这个例子表明,没有order
,元素以通常的列主要方式填充,而使用order=[2,1]
,第二维运行得更快,因此元素按行填充。这里的关键是 order
指定 LHS 的哪个维度(而不是源数组)运行得更快(正如上面的答案所强调的)。
现在我们将相同的机制应用于更高维的情况。一、没有order
的5维数组的reshape()
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5] )
对应于显式循环
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dimension of LHS
do i1 = 1, n1 !! (4)
do i4 = 1, n4 !! (3)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i3 = 1, n3 !! (1)-st dimension of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
其中matA_seq
是matA
的顺序视图
real, pointer :: matA_seq(:)
matA_seq( 1 : n1*n2*n3*n4*n5 ) => matA(:,:,:,:,:)
现在将order=[3,2,4,1,5]
附加到reshape()
,
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5], order = [3,2,4,1,5] )
然后改变 DO 循环的顺序,使得
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dim of LHS
do i3 = 1, n3 !! (1)
do i1 = 1, n1 !! (4)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i4 = 1, n4 !! (3)-rd dim of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
这意味着matB
(因此i4
)的第三维运行速度最快(对应于上述答案中的第二行)。但是OP想要的是
k = 0
do i5 = 1, n5 !! (5)-th dim of LHS
do i4 = 1, n4 !! (3)
do i3 = 1, n3 !! (1)
do i2 = 1, n2 !! (2)
do i1 = 1, n1 !! (4)-th dim of LHS
k = k + 1
matB( i3, i2, i4, i1, i5 ) = matA_seq( k )
enddo;enddo;enddo;enddo;enddo
对应
matB = reshape( matA, [n3,n2,n4,n1,n5], order = [4,2,1,3,5] )
即法国人回答的最后一行。
希望这个比较能进一步阐明情况......
【讨论】:
谢谢,我同意这不是很直观,尽管我确实发现您使用matA
的“扁平化”视图确实有助于进一步阐明 order
的使用。
谢谢。你的解释很有用。最后,在 order 选项中,我们根据原始顺序选择目标数组的位置。以上是关于Fortran 重塑 - N 维转置的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章