BizTalk 中的 FHIR JSON 到 XML 解码

Posted 2023-02-15

【中文标题】BizTalk 中的 FHIR JSON 到 XML 解码

【英文标题】：FHIR JSON to XML decoding in BizTalk

【发布时间】：2017-07-06 08:44:33

【问题描述】：

我刚开始使用 FHIR 和 json，所以我的问题可能不会很好地提出。

我已经构建了一个 BizTalk 管道组件，以使用此库 https://github.com/ewoutkramer/fhir-net-api 将 FHIR-json 转换为 FHIR-xml，基于我在此处找到的示例 http://soapfault.com/blog/2016/08/hl7-fhir-json-decoding-in-biztalk/

这是来自管道组件的代码 sn-p。它几乎与示例相同。

//Read the json message
                        using (TextReader tr = new StreamReader(originalDataStream))
                        
                            json = tr.ReadToEnd();
                        

                        //Use FHIR-NET-API to create a FHIR resource from the json
                        Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader resourceReader = new Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(FhirJsonParser.CreateFhirReader(json), ParserSettings.Default);

                        //Use FHIR-NET-API to serialize the resource to XML
                        byte[] resourceXmlBytes = Hl7.Fhir.Serialization.FhirSerializer.SerializeToXmlBytes(resourceReader.Deserialize());

管道组件能够解码任何以 "resourceType": "ImagingStudy",

但我收到这样开头的消息的解析错误，

  "resourceType" : "Bundle",
  "entry" : [
      "resource" : 
        "resourceType" : "ImagingStudy",

或

  "entry": [
    
      "fullUrl":     "http://fhirtest.uhn.ca/baseDstu2/ImagingStudy/EXexample",
      "resource": 
        "resourceType": "ImagingStudy",

这是我遇到的几个错误，

There was a failure executing the receive pipeline: "LALALA.Imaging.Pipelines.FHIRJasonDecoderRP, LALALA.Imaging.Pipelines, Version=1.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=19bb8b5ea64396aa" Source: "FHIRJsonDecoder" Receive Port: "RP_LA_Test_FILE" URI: "D:\Projects\LALALA.Imaging\In\*.json" Reason: Data at the root level is invalid. Line 1, position 1.

或

Reason: At line 1, pos 1: Cannot determine type of resource to create from json input data: no member resourceType was found

对于我的解决方案，最终目标是能够将 FHIR 图像研究消息包解析为单个 fhir xml 消息，然后将其映射到 HL7 ORU 消息。

对于上述问题的任何帮助或有关如何使用 BizTalk 实现我的最终目标的建议将不胜感激。

【参考方案1】：

通常不需要直接调用 ResourceReader，但我尝试重现您的错误，如下所示：

var json = @"
            ""resourceType"" : ""Bundle"",
            ""entry"" : [
                  ""resource"" : 
                       ""resourceType"" : ""ImagingStudy""
                                       ]";

// SHORT VERSION: var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(json);
var b = new     
             Hl7.Fhir.Serialization.ResourceReader(
               FhirJsonParser.CreateFhirReader(json),  
                          ParserSettings.Default).Deserialize();

Assert.IsNotNull(b);

但是，两者都可以正常工作。读取流时可能出现问题？

您也可以尝试直接从流中读取：

var b = new FhirJsonParser().Parse<Bundle>(new 
                     Newtonsoft.Json.JsonTextReader(stream));

【讨论】：

感谢 Ewout，我能够编辑我的一些示例“捆绑”消息并让管道将它们解码为 XML。我仍然不确定其他人有什么问题，但现在我有一个工作示例可供参考。