从 pandas 数据帧转换为 LabeledPoint RDD
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【中文标题】从 pandas 数据帧转换为 LabeledPoint RDD【英文标题】:Convert from pandas dataframe to LabeledPoint RDD 【发布时间】:2017-03-22 10:39:32 【问题描述】:我正在一个非常简单的数据集上运行一些测试,该数据集基本上由数字数据组成。 可以找到here。
我一直在使用 pandas、numpy 和 scikit-learn 很好,但是在迁移到 Spark 时,我无法以正确的格式设置数据以将其输入到决策树中。
我这样做没有用:
df = pd.read_csv('http://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/poker/poker-hand-training-true.data')
raw_data = sc.parallelize(df)
train_dataset = raw_data.map(lambda line: line.split(","))\
.map(lambda line:LabeledPoint(line[10], np.array([float(x) for x in line[0:10]])))
尝试在 map 函数中访问 line
时,我不断收到 IndexError: list index out of range
。
当我实际下载文件并更改代码如下时,我才设法让它工作:
raw_data = sc.textFile('.../datasets/poker-hand-training.data')
train_dataset = raw_data.map(lambda line: line.split(","))\
.map(lambda line:LabeledPoint(line[10], np.array([float(x) for x in line[0:10]])))
如果我不想下载数据集,是否可以使用 read_csv
直接从 pandas 数据帧中获取数据?
【问题讨论】:
【参考方案1】:我建议您先将Pandas DataFrame
转换为Spark DataFrame
。您可以使用sqlContext.createDataFrame 方法来做到这一点。
df = pd.read_csv('http://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/poker/poker-hand-training-true.data', names=['S1','C1','S2','C2','S3','C3','S4','C4','S5','C5','class'])
s_df = spark.createDataFrame(df)
现在您可以使用此 Dataframe 来获取您的训练数据集。
train_dataset = s_df.rdd.map(lambda x: LabeledPoint(x[10], x[:10])).collect()
【讨论】:
最好的单行转换!以上是关于从 pandas 数据帧转换为 LabeledPoint RDD的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
从 Pandas 数据帧到 Spark 数据帧的转换需要大量时间
将列表写入 pandas 数据帧到 csv,从 csv 读取数据帧并再次转换为列表而无需字符串
用 NA 值填充 dict 以允许转换为 pandas 数据帧