将具有最接近值的列添加到 PySpark Dataframe

Posted 2023-04-13

【中文标题】将具有最接近值的列添加到 PySpark Dataframe

【英文标题】：Add column with closest vaues to PySpark Dataframe

【发布时间】：2019-10-11 05:35:32

【问题描述】：

我有一个 PySpark 数据框（比如 df），它有两列（Name 和 Score）。以下是数据框的示例：

+------+-----+
|  Name|Score|
+------+-----+
| name1|11.23|
| name2|14.57|
| name3| 2.21|
| name4| 8.76|
| name5|18.71|
+------+-----+

我有一个 numpy 数组（比如 bin_array），它的值接近 PySpark 数据框的标题为 Score 的列中的数值。

下面是前面提到的numpy数组：

bin_array = np.array([0, 5, 10, 15, 20])

我想将Score 列中每一行的值与bin_array 中的值进行比较，并将最接近的值（从bin_array 获取）存储在 PySpark 数据框中的单独列中。

下面是我希望我的新数据框（比如df_new）的外观。

+------+-----+------------+
|  Name|Score| Closest_bin|
+------+-----+------------+
| name1|11.23|      10.0  |
| name2|14.57|      15.0  |
| name3| 2.21|       0.0  |
| name4| 8.76|      10.0  |
| name5|18.71|      20.0  |
+------+-----+------------+

我有下面提到的函数，它给了我最接近 bin_array 的值。当我用单独的数字测试它时，该功能可以正常工作。

def find_nearest(array, value):
    array = np.asarray(array)
    idx = (np.abs(array - value)).argmin()
    return float(array[idx])

在我的实际工作中，我会在datafrmae 中有数百万行。 创建df_new 的最有效方法是什么？

以下是我尝试用来创建用户定义函数 (udf) 和新数据框 (df_new) 的步骤。

closest_bin_udf = F.udf( lambda x: find_nearest(array, x) )
df_new = df.withColumn( 'Closest_bin' , closest_bin_udf(df.Score)  )

但是，当我尝试df_new.show() 时出现错误。部分错误如下所示。

---------------------------------------------------------------------------
Py4JJavaError                             Traceback (most recent call last)
<ipython-input-11-685c9b7e25d9> in <module>()
----> 1 df_new.show()

/usr/lib/spark/python/pyspark/sql/dataframe.py in show(self, n, truncate, vertical)
    376         """
    377         if isinstance(truncate, bool) and truncate:
--> 378             print(self._jdf.showString(n, 20, vertical))
    379         else:
    380             print(self._jdf.showString(n, int(truncate), vertical))

您可以使用下面提到的步骤来创建上述数据框：

from pyspark.sql import *
import pyspark.sql.functions as F
import numpy as np

Stats = Row("Name", "Score")

stat1 = Stats('name1', 11.23)
stat2 = Stats('name2', 14.57)
stat3 = Stats('name3', 2.21)
stat4 = Stats('name4', 8.76)
stat5 = Stats('name5', 18.71)

stat_lst = [stat1 , stat2, stat3, stat4, stat5]
df = spark.createDataFrame(stat_lst)

df.show()

【参考方案1】：

您可以使用来自pyspark.mllib 的bucketizer

from pyspark.sql import *
import pyspark.sql.functions as F
import numpy as np

Stats = Row("Name", "Score")

stat_lst = [Stats('name1', 11.23) , Stats('name2', 14.57), Stats('name3', 2.21), Stats('name4', 8.76), Stats('name5', 18.71)]
df = spark.createDataFrame(stat_lst)

from pyspark.ml.feature import Bucketizer

"""
Bucketizer creates bins like 0-5:0, 5-10:1, 10-15:2, 15-20:3
As I see, your expected output wants the closest numbered bin, so you might 
have to change your buckets or the variable `t` below accordingly.
"""
bucket_list = [0, 5, 10, 15, 20]

bucketizer = Bucketizer(splits=bucket_list, inputCol="Score", outputCol="buckets")
df_buck = bucketizer.setHandleInvalid("keep").transform(df)

df_buck.show()

我仍在努力寻找最近的垃圾箱，我会更新我的答案。

如果您想要每个存储桶的数组值，您可以使用 udf 创建一个包含存储桶名称的新列

from pyspark.sql.functions import udf
from pyspark.sql.types import *

t = dict(zip(range(len(bucket_list)), bucket_list))
udf_foo = udf(lambda x: t[x], IntegerType())
df_buck = df_buck.withColumn("score_bucket", udf_foo("buckets"))

输出

>>> df_buck.show()

+-----+-----+-------+------------+
| Name|Score|buckets|score_bucket|
+-----+-----+-------+------------+
|name1|11.23|    2.0|          10|
|name2|14.57|    2.0|          10|
|name3| 2.21|    0.0|           0|
|name4| 8.76|    1.0|           5|
|name5|18.71|    3.0|          15|
+-----+-----+-------+------------+

编辑：更正分数桶：

# Not dynamic, but please try to figure out this business logic according to your use-case
df_buck = df_buck.withColumn("correct_buckets", F.when(df_buck.Score-df_buck.score_bucket > 5/2, F.col("score_bucket") + 5).otherwise(F.col("score_bucket"))).drop("buckets", "score_bucket")

现在输出符合预期：

+-----+-----+---------------+
| Name|Score|correct_buckets|
+-----+-----+---------------+
|name1|11.23|             10|
|name2|14.57|             15|
|name3| 2.21|              0|
|name4| 8.76|             10|
|name5|18.71|             20|
+-----+-----+---------------+

【讨论】：

非常好的帖子@pisall：我能够很好地运行代码直到最后一行df_buck.show()。当 df_buck.show() 尝试执行 df_buck = df_buck.withColumn("score_bucket", udf_foo("buckets")) 时，我收到以下错误：``` 19 df_buck = df_buck.withColumn( "kk_bucket", udf_nearest_bin("buckets") ) ---> 20 df_buck.show() /usr /lib/spark/python/pyspark/sql/dataframe.py in show(self, n, truncate, vertical) 377 if isinstance(truncate, bool) and truncate: --> 378 print(self._jdf.showString(n, 20, 垂直))```

@SiddharthSatpathy 无法理解，这是非常小的信息。我需要Py4JError 或AnalysisException 之后的错误。如果您喜欢使用编辑，可以将其添加到您的问题中

我能够解决这个错误。感谢这个很棒的答案。 =)

【参考方案2】：

您也可以pandas_udf，尽管我建议您在扩大规模时测试速度和内存消耗

from pyspark.sql.functions import pandas_udf, PandasUDFType
import numpy as np
import pandas as pd
df = spark.createDataFrame(zip(["name_"+str(i) for i in range(1,6)], [11.23, 14.57, 2.21, 8.76, 18.71]), ["Name", "Score"])

bin_array = np.array([0, 5, 10, 15, 20])

@pandas_udf('double', PandasUDFType.SCALAR)
def find_nearest(value):
    res = bin_array[np.newaxis, :] - value.values[:, np.newaxis]
    ret_vals = [bin_array[np.argmin(np.abs(i))] for i in res]
    return pd.Series(ret_vals)

df.withColumn('v2', find_nearest(df.Score)).show()

输出

+------+-----+----+
|  Name|Score|  v2|
+------+-----+----+
|name_1|11.23|10.0|
|name_2|14.57|15.0|
|name_3| 2.21| 0.0|
|name_4| 8.76|10.0|
|name_5|18.71|20.0|
+------+-----+----+

【讨论】：

你有没有机会看到函数如何随着更大的数据进行缩放？