在我的包中使用例如 ddply 时，如何摆脱 R CMD 检查生成的注释？

Posted 2023-03-24

【中文标题】在我的包中使用例如 ddply 时，如何摆脱 R CMD 检查生成的注释？

【英文标题】：How do I get rid of the NOTE's generated by R CMD check when using for example ddply in my package?

【发布时间】：2015-05-05 06:50:49

【问题描述】：

我有一个与How can I handle R CMD check "no visible binding for global variable" notes when my ggplot2 syntax is sensible? 相似但又不同的问题。

在那种情况下，使用 aes_string 而不是 aes，一切都会顺利进行。但是，这对于 plyr afaik 是不可能的。

例如，当我通过 ddply 引用数据框中的列名时，就会出现问题。

ddply(mydf, .(VarA, VarB, VarC, VarD), summarize, sum = sum(VarE))
#
# MyPackage: no visible binding for
#   global variable ‘VarA’

这段代码是完全有效和理智的，即使我理解注释的使用，它们仍然会混淆输出窗口中的其他消息，使包开发成为一种痛苦，实际上迫使开发人员忽略注释。

摆脱这些笔记的正确方法是什么？或者，以 R CMD check 接受而不给出 NOTE 的方式编写代码的正确方法是什么？

最好， 迈克尔

【参考方案1】：

有几种解决方法。最简单的方法是将NULL 分配给所有没有可见绑定的变量。

VarA <- VarB <- VarC <- VarD <- VarE <- NULL

更优雅的解决方案是使用as.quoted 和substitute。 @Dr. 更新。 Mike：对as.quoted的调用需要用c()封装。

ddply(mydf, 
      as.quoted(c('VarA', 'VarB', 'VarC', 'VarD')), 
      summarize, 
      sum = sum(substitute(VarE)))

【参考方案2】：

您可以通过声明全局变量来避免 CMD 检查警告：

globalVariables(c("VarA", "VarB"))

使用前请阅读?globalVariables，并确保将适当的 R 版本添加到您的说明中。

通过引用避免使用全局变量总是可取的。