在矩阵上使用带有均值函数的 mapply
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【中文标题】在矩阵上使用带有均值函数的 mapply【英文标题】:Using mapply with mean function on a matrix 【发布时间】:2015-07-01 18:04:11 【问题描述】:我希望计算矩阵每一列(或行)中相邻值的平均值(例如 [1,1] 和 [2,1]、[2,1] 和 [3,1] 的平均值, [3,1] 和 [4,1]) 并将其应用于所有列。
我尝试使用 mapply 函数(以避免使用 for 循环)来计算每列中前 2 个值的平均值,并计划将其逐行应用于整个矩阵。但是,如果我尝试对这些值求和而不是对均值函数求和,这似乎可行。
请看下面的例子:
x <- matrix(c(NA,rnorm(28),NA), nrow=6, ncol=5)
print(x)
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] NA -0.6557176 1.7741320 0.3667700 -0.5548408
[2,] 0.14001643 0.2521062 -0.1295084 -0.4272368 0.7598425
[3,] 0.32123196 0.5736409 0.8618268 2.1535191 0.4686728
[4,] 0.06573949 -1.2101965 -0.4308219 -0.2624877 -0.3751350
[5,] -0.66247996 1.2743463 1.6044236 1.2004990 -0.3283678
[6,] 1.05005260 1.2264607 3.2347421 -0.8113528 NA
mapply(sum, x[1,], x[2,])
[1] NA -0.40361136 1.64462358 -0.06046682 0.20500169
# gives the sum of the input of rows 1 and 2 for each column, as expected
mapply(mean, x[1,], x[2,])
[1] NA -0.6557176 1.7741320 0.3667700 -0.5548408
# gives the actual values across row 1
使用均值函数时,输出似乎是第一行的值。我怀疑问题在于索引正确的输入值。
【问题讨论】:
【参考方案1】:你可以使用:
library(zoo)
apply(x, 2, function(x) rollapply(x, 2, mean))
【讨论】:
【参考方案2】:我认为这会做你想要的:
(head(x, -1L) + tail(x, -1L)) / 2
产生(使用set.seed(1)
的数据):
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[2,] NA -0.1665197 -0.11569867 0.8825287 -0.6847630
[3,] -0.2214052 0.6128769 -1.41797023 0.7075613 0.2818485
[4,] -0.3259926 0.6570530 -0.54488448 0.7564393 -0.1059621
[5,] 0.3798261 0.1351965 0.53999865 0.8505568 -0.8132739
[6,] 0.9623943 0.6031964 -0.03056194 0.4283506 NA
tail(x, -1L)
给出除了第一行之外的每一行的矩阵。所以结果矩阵的第一行是原始矩阵的第二行,第二行是第三行,依此类推。然后我们将其添加到原始矩阵减去第一行。这相当于将第 2 行添加到第 1 行,将第 3 行添加到第 2 行,等等。最后我们只需除以 2,得到平均值。
您的方法失败的原因是 mean
仅对其第一个参数求平均值,而 sum
将其所有参数求和:
> args(mean)
function (x, ...)
NULL
> args(sum)
function (..., na.rm = FALSE)
NULL
sum
将所有...
相加,但mean
仅取x
的平均值,因此您传递给mean
和mapply
的第二行将被丢弃(或更糟的是,正在使用作为trim
参数,请参见?mean
)。
【讨论】:
以上是关于在矩阵上使用带有均值函数的 mapply的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
R语言(数值列表矩阵)上应用函数(sqrtroundmeanlog)将矩阵所有数据求对数就矩阵整体的均值使用apply函数计算矩阵matrix的行均值列均值trim设置返回结果精度