MPI C,基于值的 Allreduce 结构
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【中文标题】MPI C,基于值的 Allreduce 结构【英文标题】:MPI C, Allreduce struct based on a value 【发布时间】:2022-01-01 07:09:50 【问题描述】:我正在尝试查找某些本地子数组的最大绝对值。尝试将原始值共享给其他处理器时会出现问题,因为该值必须保留其原始符号(正或负)
所以我有这个结构:
struct max_data
int index;
double real_value, absolute_value;
;
求最大绝对值的函数:
struct max_data find_max_absolute(double vec[], int size)
double max = absolute(vec[0]), current = 0;
int position = 0;
struct max_data a;
for (int i = 1; i < size; i++)
current = absolute(vec[i]);
if (current > max)
position = i;
max = current;
a.index = position;
a.real_value = vec[position];
a.absolute_value = max;
return a;
在主目录中,我使用了以下代码:
// ...
struct max_data local_max_data = find_max_data(local_result, size);
local_max_value = local_max_data.absolute_value;
MPI_Allreduce(&local_max_value, &max_value, 1, MPI_DOUBLE, MPI_MAX, MPI_COMM_WORLD);
我可以创建自定义操作或数据类型吗?
【问题讨论】:
是的,您将需要自定义数据类型和操作。 【参考方案1】:您需要定义一个自定义归约运算符。
void abs_max(void *in,void *inout,int *len,MPI_Datatype *type)
// r is the already reduced value, n is the new value
float n = *(float*)in, r = *(float*)inout;
float m;
if (fabs(n)>fabs(r))
m = n;
else m = r;
#ifdef DEBUG
printf("combine %e %e : %d\n",r,n,m);
#endif
*(float*)inout = m;
然后您将其用作:
MPI_Op calc_absmax;
MPI_Op_create(abs_max,1,&calc_absmax);
MPI_Allreduce(&data,&data_abs_max,1,MPI_FLOAT,calc_absmax,comm);
MPI_Op_free(&calc_absmax);
【讨论】:
以上是关于MPI C,基于值的 Allreduce 结构的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
MPI通信的几种模式, Broadcast, Scatter, Gather, Allgather, Reduce, AllReduce