Sklearn 指标值与 Keras 值非常不同

Posted 2023-03-12

【中文标题】Sklearn 指标值与 Keras 值非常不同

【英文标题】：Sklearn metrics values are very different from Keras values

【发布时间】：2019-07-02 00:04:31

【问题描述】：

我需要一些帮助来了解在 Keras 中拟合模型时如何计算准确性。 这是训练模型的示例历史记录：

Train on 340 samples, validate on 60 samples
Epoch 1/100
340/340 [==============================] - 5s 13ms/step - loss: 0.8081 - acc: 0.7559 - val_loss: 0.1393 - val_acc: 1.0000
Epoch 2/100
340/340 [==============================] - 3s 9ms/step - loss: 0.7815 - acc: 0.7647 - val_loss: 0.1367 - val_acc: 1.0000
Epoch 3/100
340/340 [==============================] - 3s 10ms/step - loss: 0.8042 - acc: 0.7706 - val_loss: 0.1370 - val_acc: 1.0000
...
Epoch 25/100
340/340 [==============================] - 3s 9ms/step - loss: 0.6006 - acc: 0.8029 - val_loss: 0.2418 - val_acc: 0.9333
Epoch 26/100
340/340 [==============================] - 3s 9ms/step - loss: 0.5799 - acc: 0.8235 - val_loss: 0.3004 - val_acc: 0.8833

那么，第一个 epoch 的验证准确度是 1？验证准确率如何优于训练准确率？

这些数字显示了准确度和损失的所有值：

然后我使用 sklearn 指标来评估最终结果：

def evaluate(predicted_outcome, expected_outcome):
    f1_score = metrics.f1_score(expected_outcome, predicted_outcome, average='weighted')
    balanced_accuracy_score = metrics.balanced_accuracy_score(expected_outcome, predicted_outcome)
    print('****************************')
    print('| MODEL PERFORMANCE REPORT |')
    print('****************************')
    print('Average F1 score = :0.2f.'.format(f1_score))
    print('Balanced accuracy score = :0.2f.'.format(balanced_accuracy_score))
    print('Confusion matrix')
    print(metrics.confusion_matrix(expected_outcome, predicted_outcome))
    print('Other metrics')
    print(metrics.classification_report(expected_outcome, predicted_outcome))

我得到了这个输出（如你所见，结果很糟糕）：

****************************
| MODEL PERFORMANCE REPORT |
****************************
Average F1 score = 0.25.
Balanced accuracy score = 0.32.
Confusion matrix
[[  7  24   2  40]
 [ 11  70   4 269]
 [  0   0   0  48]
 [  0   0   0   6]]
Other metrics
              precision    recall  f1-score   support

           0       0.39      0.10      0.15        73
           1       0.74      0.20      0.31       354
           2       0.00      0.00      0.00        48
           3       0.02      1.00      0.03         6

   micro avg       0.17      0.17      0.17       481
   macro avg       0.29      0.32      0.12       481
weighted avg       0.61      0.17      0.25       481

为什么 Keras 拟合函数的准确率和损失值与 sklearn 指标的值相差如此之大？

这是我的模型，以防万一：

model = Sequential()

model.add(LSTM(
                units=100, # the number of hidden states
                return_sequences=True, 
                input_shape=(timestamps,nb_features),
                dropout=0.2, 
                recurrent_dropout=0.2
              )
         )

model.add(Dropout(0.2))

model.add(Flatten())

model.add(Dense(units=nb_classes,
               activation='softmax'))

model.compile(loss="categorical_crossentropy",
              metrics = ['accuracy'],
              optimizer='adadelta')

输入数据维度：

400 train sequences
481 test sequences
X_train shape: (400, 20, 17)
X_test shape: (481, 20, 17)
y_train shape: (400, 4)
y_test shape: (481, 4)

这就是我应用 sklearn 指标的方式：

testPredict = model.predict(np.array(X_test))
y_test = np.argmax(y_test.values, axis=1)
y_pred = np.argmax(testPredict, axis=1)
evaluate(y_pred, y_test)

我好像错过了什么。

【参考方案1】：

你听起来有点困惑。

首先，您将苹果与橙子进行比较，即 Keras 在 60 个样本集上报告的验证准确度（请注意 Keras 打印的第一条信息性消息，Train on 340 samples, validate on 60 samples）与测试 scikit-learn 在您的 481 样本测试集上报告的准确度。

其次，您只有 60 个样本的验证集太小了；在如此小的样本中，计算指标的剧烈波动（例如您报告的指标）当然不会出乎意料（我们需要足够大小的数据集，而不仅仅是训练数据集是有原因的）。 p>

第三，你的训练/验证/测试集划分很不寻常，至少可以这么说；标准做法要求分配大约 70/15/15% 或类似，而您使用的是 38/7/55% 的分配（即 340/60/481 个样本）...

最后，在不知道您的数据细节的情况下，很可能只有 340 个样本不足以适合像您这样的 LSTM 模型来完成良好的 4 类分类任务。

对于初学者，首先将数据更适当地分配到训练/验证/测试集中，并确保将苹果与苹果进行比较...

PS 在类似的问题中，您还应该包括您的model.fit() 部分。

【讨论】：

嗨，我面临着非常相似的情况。阅读您的答案后，我检查了 Sklearn 和 Keras 是否使用相同的验证集大小和数据。但是，Keras model.fit 输出显示 85% val_acc。同时，在 Sklearn 的 metrics.confusion 矩阵上，它显示 78% 的 True Positives 和 78% 的 True Negatives。我应该问一个新问题还是重复这个问题？谢谢！

@JairoAlves 我建议你确实打开一个新问题

@JairoAlves 一年后，你做了什么？我有同样的问题。 keras 和 sklearn 中的数字相同，但一个报告 90%，另一个报告 56%。

@PolarBear10 看起来他们打开了this question，我似乎也已经回答了。