Python 看不到 pygraphviz

Posted 2023-03-12

【中文标题】Python 看不到 pygraphviz

【英文标题】：Python does not see pygraphviz

【发布时间】：2013-03-17 16:24:26

【问题描述】：

我已经使用 easy_install 安装了 pygraphviz 但是当我启动 python 时出现错误：

>>>import pygraphviz as pgv
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: No module named pygraphviz
>>> 

使用 Ubuntu 12.04 和 gnome-terminal。

【问题讨论】：

您是否使用过virtulenv，如果有，请确认您安装包的环境是否与您可能调用脚本或调用shell的环境相同？

不知道有没有用过virtulenv。如何检查我是否在同一环境中安装了pyhraphviz和python？

我刚刚输入了easy_install pyhraphviz

Ok 在你的 gnoe 终端中执行以下操作 1.pip install virtualenv 2.virtualenv myenv 3.source myenv/bin/activate 4.pip install pygraphviz 然后运行 ​​python 并尝试import pygraphviz 检查它是否有效.

好的，我想出了问题。您可能缺少 libgraphviz-dev。您可以使用sudo apt-get install libgraphviz-dev 安装它。您可以使用dpkg -l | grep 'graphviz'

检查是否安装了graphviz

【参考方案1】：

假设您使用的是 Ubuntu，请查看以下步骤

sudo apt-get install graphviz libgraphviz-dev pkg-config 如果需要，创建并激活virtualenv。命令看起来像sudo apt-get install python-pip python-virtualenv 运行pip install pygraphviz 运行终端并通过导入检查它是否有效

【讨论】：

是的，pkg-config很重要，否则pip install pygraphviz将无法编译，导致library_path。

ImportError: undefined symbol: Agundirected ，如 here 所述。

确保您重新启动终端...这样您的更改才会受到影响

【参考方案2】：

在 Ubuntu 14.04 上，自动检测 graphviz 库和包含文件存在问题。如果您按照以下步骤操作，您可能会很安全。

1) sudo apt-get install graphviz libgraphviz-dev pkg-config python-pip
2) pip install pygraphviz --install-option="--include-path=/usr/include/graphviz" --install-option="--library-path=/usr/lib/graphviz/" 

【讨论】：

谢谢你，在 Ubuntu 16.04 LTS 上尝试通过 pip 安装 pygraphz 时也适用于我

这些安装选项也适用于我在 macOS 上遇到同样的错误（运行 brew install graphviz），除了路径是 /usr/local/include/graphviz 而库是 /usr/local/lib/graphviz，所以完整的命令是：@ 987654325@.

在 Ubuntu 18.04 上，我可以使用 sudo apt-get install graphviz libgraphviz-dev graphviz-dev 后跟 pip install pygraphviz 来完成它

也适用于 ubuntu 20.04 LTS。我需要这个才能安装它..

【参考方案3】：

快速简便的解决方案是：

sudo apt-get install -y python-pygraphviz

使用 pip 也可以，但请确保您已经安装了 graphviz、libgraphviz-dev 和 pkg-config。

sudo apt-get install -y graphviz libgraphviz-dev pkg-config python-pip
sudo pip install pygraphviz

【讨论】：

为什么需要这些？如果没有 libgraphviz-dev，安装（和使用）python-pygraphviz 对我来说似乎工作得很好。如果它不是显式依赖，那么为什么需要提前这样做？为什么还有其他依赖？

这已在大约 3 年前得到回答，可能他们现在已经改变了 pygraphviz 的打包方式，因此这并不是全部必要的。如果是这种情况，您应该在此处发布对此的答案。

谢谢！对我来说，只需安装 python-pygraphviz 即可解决问题

【参考方案4】：

在 Mac OSX 上，以下对我有用：

pip install graphviz
pip install cgraph
export PKG_CONFIG_PATH=/usr/local/lib/pkgconfig 
cd /usr/local/include/graphviz 
sudo ln -s . graphviz 
pip install pygraphviz

[按照建议，将之前 /urs/local/ 改成 /usr/local/ 的错字]

【讨论】：

结合 pydot2 安装 + 为我工作，但将上述说明中的 'urs' 替换为 'usr'

【参考方案5】：

在 Mac OSX El Capitan 上，Bart Theeten 的解决方案有效，但您需要注意两点。最初，请确保您在计算机上安装了 graphviz。您可以使用自制软件：

brew install graphviz

另一件事是确保将包的路径添加到 PYTHONPATH

export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:/usr/local/lib/python2.7/site-packages/

【参考方案6】：

在 Ubuntu 15.10+（即 2015ish Debian）下，快速简单的解决方案是：

sudo apt-get install python-pygraphviz

任何依赖都被 apt 正确拉取。

【参考方案7】：

在 Colab 中，

!apt  install  libgraphviz - dev
!pip install pygraphviz

致谢：https://gist.github.com/korakot/a80c04a1945b06e2f4a053f92fecfbf9