sklearn KFold() - 将所有折叠保存到 csv 文件
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【中文标题】sklearn KFold() - 将所有折叠保存到 csv 文件【英文标题】:sklearn KFold() - save all the folds to the csv file 【发布时间】:2017-10-18 17:19:58 【问题描述】:我正在关注 Jeff Heaton 深度学习课程Course link
也跟着练习。在第一个编程作业的问题 5 中,在最后一个任务中,他要求将KFold(5)
交叉验证的输入数据的输出写入 csv 文件。基本上在 KFold(5) 之后,我们将有 5 组数据(训练/测试)。我需要将它们粘合在一起并将它们保存在一个文件中。我试图这样做,但是我的数据被覆盖了,我只得到了输出中的最后一个折叠数据。
我从 Python 开始,我想我看不到如何使循环正确附加熊猫。
练习链接:Exercise 5
我的部分代码:df_car
是原始的 pandas df。 df_cars1
是 df_cars
的副本,但我将其设为空以便以后附加数据
kf = KFold(5)
# df_cars.insert(0,'set', 'str')
df_cars.insert(1,'iteration', 0)
df_cars1 = pd.DataFrame(data=None, columns=df_cars.columns,index=df_cars.index)
df_cars1.dropna()
fold = 1
for train_index, validate_index in kf.split(df_cars):
trainDF = pd.DataFrame(df_cars.ix[train_index])
validateDF = pd.DataFrame(df_cars.ix[validate_index])
trainDF[['set', 'iteration']] = 'T', fold
validateDF[['set', 'iteration']] = 'V', fold
print("Fold #, Training Size: , Validation Size: ".format(fold,len(trainDF),len(validateDF)))
fold+=1
df_cars1 = pd.concat([validateDF,trainDF])
df_cars1.to_csv("./data/auto-mpg-kfold5.csv")
print(df_cars1)
我的输出示例是:
mpg iteration set cylinders displacement horsepower weight acceleration year origin name
319 0.997344 5 V 4 -0.705077 -0.767632 -0.506545 0.701436 80 3 mazda 626
320 1.727537 5 V 4 -0.714680 -0.322309 -0.634239 -0.206262 80 3 datsun 510 hatchback
321 1.112638 5 V 4 -0.820308 -0.767632 -0.834055 -0.133646 80 3 toyota corolla
322 2.957335 5 V 4 -1.031565 -1.029586 -1.017318 0.846667 80 3 mazda glc
如您所见,iteration
列中的所有值都是 5
的值,这意味着只有最后一个,第 5 个 KFold 被附加到 df_cars1
,我需要所有五个折叠。
任何帮助将不胜感激
【问题讨论】:
你需要缩进df_cars1 = pd.concat([validateDF,trainDF])
这一行
@gnub,我的错误,错误的代码复制/粘贴,但结果还是一样。
【参考方案1】:
问题出在 for 循环的最后一行
...
df_cars1 = pd.concat([validateDF,trainDF])
这样做是用当前的训练和验证数据重新分配 df_cars1
变量,而有关旧迭代的信息会丢失。
改成:
df_cars1 = pd.concat([df_cars1, validateDF,trainDF])
这样它将以前的折叠与这个结合起来。希望对您有所帮助。
【讨论】:
非常感谢伙计。有效。它使用 NaN 添加了整个 df,但在使用df_cars1.dropna(inplace=True)
删除它们之后,数字现在是正确的。
@kuatroka 是的,因为它会在循环的第一次迭代中添加空的df。以上是关于sklearn KFold() - 将所有折叠保存到 csv 文件的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
为啥用 shuffle 调用 KFold 生成器会给出相同的索引?
为啥用 shuffle 调用 KFold 生成器会给出相同的索引?
sklearn.model_selection 'KFold' 对象不可迭代
使用 sklearn 的 KFold 分离 pandas 数据框
sklearn可视化不同数据划分方法的差异:KFold, ShuffleSplit,StratifiedKFold, GroupKFold, StratifiedShuffleSplit.......