加载 rJava 时出错

Posted 2023-03-10

【中文标题】加载 rJava 时出错

【英文标题】：Error while loading rJava

【发布时间】：2012-11-04 09:24:35

【问题描述】：

当我想加载 rJava 时出现错误。 JDK 已安装。 （我在 CentOS 虚拟机上运行 R（cloudera demo vm cdh3u4））

> library(rJava)

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/home/cloudera/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/2.15/rJava/libs/rJava.so':
  libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
Error: package/namespace load failed for ‘rJava’

LD_LIBRARY_PATH 设置有问题吗？如果是，我该如何解决？ 我需要运行 rJava 以便稍后安装 rhdfs。

更多信息（如果需要）：

[cloudera@localhost ~]$ java -version
java version "1.6.0_31"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.6.0_31-b04)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 20.6-b01, mixed mode)

【参考方案1】：

对于 Ubuntu，安装了 oracle-java (7/8)。它将在此位置 /usr/lib/jvm 并且需要 sudo 访问权限。

使用以下条目创建文件/etc/ld.so.conf.d/java.conf：

/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64
/usr/lib/jvm/java-8-oracle/jre/lib/amd64/server

（将 java-8-oracle 替换为 java-7-oracle 或 java-7-openjdk-amd64，具体取决于您的 java 版本）

然后：

sudo ldconfig

重启 RStudio，然后安装 rJava 包。

【讨论】：

它解决了我在安装rJava、RWeka、FSelector 等过程中出现的所有问题。成千上万的“谢谢”！

这是 rJava 找不到 JVM 的真正解决方案。我在win7上遇到了类似的问题。这是两个平台上的问题的服务器目录。

您可以在我的回答中找到更详细的解释 - ***.com/a/25932828/3409405

【参考方案2】：

让 rJava 工作在很大程度上取决于您的计算机配置。以下至少在 windows 平台上工作。您可以尝试检查一下，这是否对您的平台也有帮助。

您必须使用相同的 32 位或 64 位版本：R 和 JDK/JRE。这种混合永远不会奏效（至少对我而言）。

如果您使用 64 位版本，请确保您不要将 JAVA_HOME 设置为环境变量。如果设置了这个变量，无论出于何种原因，rJava 都将无法工作。您可以检查您的 JAVA_HOME 是否设置在 R 中：

Sys.getenv("JAVA_HOME")

如果您需要设置 JAVA_HOME（例如，您需要它用于 maven 或其他），您可以在加载 rJava 之前使用以下代码在您的 R-session 中停用它：

if (Sys.getenv("JAVA_HOME")!="")
  Sys.setenv(JAVA_HOME="")
library(rJava)

在大多数情况下，这应该可以解决问题。此外，这也将解决问题Using the rJava package on Win7 64 bit with R。我从R: rJava package install failing借用了取消设置环境变量的想法。