Python print -> Perl STDIN 跳行问题

Posted 2023-03-06

【中文标题】Python print -> Perl STDIN 跳行问题

【英文标题】：Python print -> Perl STDIN line skip problem

【发布时间】：2018-09-14 01:02:32

【问题描述】：

我是 perl 和 python 的新手。

我需要在 python(dataframe) 中处理文件，并且该文件需要在 Perl 中计算。

一开始我尝试使用python子进程，但它不工作（borken pipe）

我需要从python多行，perl代码需要读取和处理。

我只是使用 |在命令行中，它可以工作，但是 perl 跳过了奇数行，只读取了偶数行。

我该如何解决？

我的python代码是：

import pandas as pd

data = pd.read_csv('./data.txt', sep = '\t', header = None)

datalist = list(data[0] + '_' + data[1])

for line in kinase_list:

    print(line)

我的 perl 代码是： //

use strict;

my %new_list = ();

while (<STDIN>)
  my $line = <STDIN>;
#  print STDERR $line;
#  chomp $line;
  my ($name, $title) = split('_', <STDIN>);
  $new_list$title = $name;
  print STDERR $name, "\t", $title, "\n";


print STDERR scalar(keys %new_list);

我的 python 输出 657 行，但 perl 只输出 329 行。

我该如何解决？

【问题讨论】：

为什么需要 python 来做这个？看来您只需要前两列，为什么不直接使用perl，直接从文件中调用两列？即perl -pe "s/((.*?\t)(?2)).*/$1/" C:\users\file1.txt

还有my ($name, $title) = split '_'就够了

感谢您的回复。我需要编辑 2 个数据框并需要通过特定的 id 合并它并调整两个数据框的一些值。

哪个应该调用另一个？ python应该调用perl还是perl调用python？我不知道哪个是哪个，但你可以使用import os;print(os.popen(the_code_above).read())，它也应该可以工作

python 打印行，perl 需要读取并使其散列

【参考方案1】：

表达式 <STDIN> 从标准输入读取一行，因此您的 Perl 代码为 while 循环的每次迭代读取两行。

说够了

while (<STDIN>) 
    my $line = $_;
    ...

或者只是

while (my $line = <STDIN>) 
    ...

【讨论】：

感谢您的回复！我只是按照您的建议编辑我的代码，并成功获取所有行。谢谢！