程序在pycharm中完美运行，在终端运行时给出错误答案

Posted 2023-02-16

【中文标题】程序在pycharm中完美运行，在终端运行时给出错误答案

【英文标题】：Program run perfectly in pycharm, gives incorrect answer when run in terminal

【发布时间】：2019-05-08 09:37:03

【问题描述】：

背景。计算机科学四年级学生。一年级蟒蛇。

问题：我在两个地方运行程序，Pycharm (IDE) 和使用终端的外部服务器。相同python的输出 在这两个东西上运行时文件是不同的。我需要它 相同，最好是正确的。 （是的，python 和 fasta 文件 在终端和 Pycharm 上是一样的）。

pycharm 和终端上的文件。

Pycharm 文件：

chromosome9.fa Window.py 运行命令：python Window.py colour9.fa

终端文件

chrom9.fa Window.py 运行命令：python Window.py chrom9.fa

Pycharm 文件的输出

There are 1255728 CpG pairs in this sequence.


[(63385200, 63385679), (64711680, 64712169), (65825370, 65825849), (131739850, 131740259), (134326260, 134326859)]

[(1092400, 1092839), (1366440, 1366849), (1549650, 1550099), (4068100, 4068849), (4326450, 4327169), (9216770, 9217449), (12647450, 12648029), (14136430, 14136909), (15126110, 15126569)
, (29073770, 29074689), (39586690, 39587139), (73198340, 73198929), (74377730, 74378379), (75009180, 75009779), (75341380, 75341889), (99970290, 99970769), (103436370, 103436809)]

getting average CpGIsland length for + strand
Average length: 491.0

getting average CpGIsland length for - strand
Average length: 564.2941176470588

终端程序的输出

('There are', 1255728, 'CpG pairs in this sequence.')

[]

[]


getting average CpGIsland length for + strand
Average length : 0

getting average CpGIsland length for - strand
Average length : 0

打印语句

print("There are",len(CG_indices),"CpG pairs in this sequence.")

两者的打印效果也不同，但我目前不在乎。

有人知道发生了什么吗？

【问题讨论】：

首先猜测是 Pycharm 使用的解释器与终端使用的解释器不同

如果没有代码的相关部分，第二次猜测基本上是不可能的。看看这里如何创建minimal reproducible example。

提示服务器上的 Python 2 与 IDE 中的 Python 3 可能是答案：在 Python 2 中执行 print(something, something_else) 时，会打印一个元组，而在 Python 3 中需要括号，因为 @ 987654326@ 是函数，不再是语句。

also prints different for both but I don't care about that currently. 你应该关心。这意味着 PyCharm 在 Python3.x 上运行，而在 Python 2.x 上运行服务器。这些非常不兼容，很可能是您问题的根源。

【参考方案1】：

天哪，你们都很好。是的，我在终端上运行了 python3 Window.py chrom9.fa 并且它工作，而当我运行 python Window.py chrom9.fa 时它没有工作。你们太棒了！谢谢 Ian Quah，Graipher，很奇怪。 （Aaaaaaaaaaaaa）（内心尖叫）

仍然不知道为什么会这样，但我现在知道这显然是一个非常严重的问题。

【讨论】：

Python 提示：如果您想知道运行的是哪个 Python 版本，可以在程序顶部添加这些行（两行除以 ;）：import sys; print(sys.version)