与 openmp 的 10 维蒙特卡罗集成

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【中文标题】与 openmp 的 10 维蒙特卡罗集成【英文标题】:10 dimensional Monte Carlo integration with openmp 【发布时间】:2017-03-13 05:28:29 【问题描述】:

我正在尝试使用 openmp 学习并行化。我编写了一个 c++ 脚本,通过 MC 计算函数的 10 维积分: F = x1+ x2 + x3 +...+x10

现在我正在尝试将其转换为与具有 4 个线程的 openmp 一起使用。我的串行代码给出了可理解的输出,所以我有点相信它可以正常工作。 这是我的序列号: 我想为 N = 样本点数的每 4^k 次迭代输出。

/* compile with 

               $ g++ -o monte ND_MonteCarlo.cpp 
               $ ./monte N

   unsigned long long int for i, N
   Maximum value for UNSIGNED LONG LONG INT 18446744073709551615
*/


#include <iostream>
#include <fstream>
#include <iomanip>
#include <cmath>
#include <cstdlib>
#include <ctime>

using namespace std;


//define multivariate function F(x1, x2, ...xk)            

double f(double x[], int n)

    double y;
    int j;
    y = 0.0;

    for (j = 0; j < n; j = j+1)
      
         y = y + x[j];
           

    y = y;
    return y;


//define function for Monte Carlo Multidimensional integration

double int_mcnd(double(*fn)(double[],int),double a[], double b[], int n, int m)


    double r, x[n], v;
    int i, j;
    r = 0.0;
    v = 1.0;


    // step 1: calculate the common factor V
    for (j = 0; j < n; j = j+1)
      
         v = v*(b[j]-a[j]);
       

    // step 2: integration
    for (i = 1; i <= m; i=i+1)
    
        // calculate random x[] points
        for (j = 0; j < n; j = j+1)
        
            x[j] = a[j] +  (rand()) /( (RAND_MAX/(b[j]-a[j])));
                 
        r = r + fn(x,n);
    
    r = r*v/m;

    return r;





double f(double[], int);
double int_mcnd(double(*)(double[],int), double[], double[], int, int); 



int main(int argc, char **argv)
    



    /* define how many integrals */
    const int n = 10;       

    double b[n] = 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0,5.0;                    
    double a[n] = -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0,-5.0;  

    double result, mean;
    int m;

    unsigned long long int i, N;
    // initial seed value (use system time) 
    srand(time(NULL));  


    cout.precision(6);
    cout.setf(ios::fixed | ios::showpoint); 

    // current time in seconds (begin calculations)
    time_t seconds_i;
    seconds_i = time (NULL);

    m = 4;                // initial number of intervals

    // convert command-line input to N = number of points
    N = atoi( argv[1] );

    for (i=0; i <=N/pow(4,i); i++)
    
        result = int_mcnd(f, a, b, n, m);
        mean = result/(pow(10,10));
        cout << setw(30)  << m << setw(30) << result << setw(30) << mean <<endl;
        m = m*4; 
    



// current time in seconds (end of calculations)
    time_t seconds_f;
    seconds_f = time (NULL);
    cout << endl << "total elapsed time = " << seconds_f - seconds_i << " seconds" << endl << endl;

    return 0;

和输出:

N            integral                                mean_integral
 4            62061079725.185936                      6.206108
 16            33459275100.477665                      3.345928
 64            -2204654740.788784                     -0.220465
 256             4347440045.990804                      0.434744
 1024            -1265056243.116922                     -0.126506
 4096              681660387.953380                      0.068166
 16384             -799507050.896809                     -0.079951
 65536             -462592561.594820                     -0.046259
 262144               50902035.836772                      0.005090
 1048576              -91104861.129695                     -0.009110
 4194304                3746742.588701                      0.000375
 16777216              -32967862.853915                     -0.003297
 67108864               17730924.602974                      0.001773
 268435456                -416824.977687                     -0.00004
 1073741824                2843188.477219                      0.000284

但我认为我的并行代码根本不起作用。我当然知道我在做一些傻事。由于我的线程数是 4,我想将结果除以 4,结果很荒谬。

这是相同代码的并行版本:

/* compile with 

               $ g++ -fopenmp -Wunknown-pragmas -std=c++11 -o mcOMP parallel_ND_MonteCarlo.cpp -lm
               $ ./mcOMP N

   unsigned long long int for i, N
   Maximum value for UNSIGNED LONG LONG INT 18446744073709551615
*/


#include <iostream>
#include <fstream>
#include <iomanip>
#include <cmath>
#include <cstdlib>
#include <ctime>
#include <omp.h>

using namespace std;


//define multivariate function F(x1, x2, ...xk)            

double f(double x[], int n)

    double y;
    int j;
    y = 0.0;

    for (j = 0; j < n; j = j+1)
      
         y = y + x[j];
           

    y = y;
    return y;


//define function for Monte Carlo Multidimensional integration

double int_mcnd(double(*fn)(double[],int),double a[], double b[], int n, int m)


    double r, x[n], v;
    int i, j;
    r = 0.0;
    v = 1.0;


    // step 1: calculate the common factor V
    #pragma omp for
    for (j = 0; j < n; j = j+1)
      
         v = v*(b[j]-a[j]);
       

    // step 2: integration
    #pragma omp for
    for (i = 1; i <= m; i=i+1)
    
        // calculate random x[] points

        for (j = 0; j < n; j = j+1)
        
            x[j] = a[j] +  (rand()) /( (RAND_MAX/(b[j]-a[j])));
                 
        r = r + fn(x,n);
    
    r = r*v/m;

    return r;





double f(double[], int);
double int_mcnd(double(*)(double[],int), double[], double[], int, int); 



int main(int argc, char **argv)
    



    /* define how many integrals */
    const int n = 10;       

    double b[n] = 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0;                    
    double a[n] = -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0,-5.0;  

    double result, mean;
    int m;

    unsigned long long int i, N;
    int NumThreads = 4;


    // initial seed value (use system time) 
    srand(time(NULL));  


    cout.precision(6);
    cout.setf(ios::fixed | ios::showpoint); 

    // current time in seconds (begin calculations)
    time_t seconds_i;
    seconds_i = time (NULL);

    m = 4;                // initial number of intervals

    // convert command-line input to N = number of points
    N = atoi( argv[1] );

    #pragma omp parallel private(result, mean) shared(N, m) num_threads(NumThreads)
    for (i=0; i <=N/pow(4,i); i++)
    
        result = int_mcnd(f, a, b, n, m);
        mean = result/(pow(10,10));
        #pragma omp master
        cout << setw(30)  << m/4 << setw(30) << result/4 << setw(30) << mean/4 <<endl;
        m = m*4; 
    



// current time in seconds (end of calculations)
    time_t seconds_f;
    seconds_f = time (NULL);
    cout << endl << "total elapsed time = " << seconds_f - seconds_i << " seconds" << endl << endl;

    return 0;

我只希望主线程输出值。 我编译:

g++ -fopenmp -Wunknown-pragmas -std=c++11 -o mcOMP parallel_ND_MonteCarlo.cpp -lm

非常感谢您对修复代码的帮助和建议。非常感谢。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

让我们看看你的程序做了什么。在omp parallel,您的线程被生成,它们将并行执行剩余的代码。像这样的操作:

m = m * 4;

未定义(通常没有意义,因为它们每次迭代执行四次)。

此外,当这些线程遇到omp for 时,它们将共享循环的工作,即每个迭代将仅由某个线程执行一次。由于int_mcndparallel 区域内执行,它的所有局部变量都是私有的。您的代码中没有构造来实际收集这些私有结果(resultmean 也是私有的)。

正确的做法是使用带有reduction子句的并行for循环,表示有一个变量(r/v)在整个循环执行过程中被聚合。

为此,需要将归约变量声明为在并行区域范围之外的共享变量。最简单的解决方案是移动int_mcnd 内部的并行区域。这也避免了m 的竞争条件。

还有一个障碍:rand 正在使用全局状态,至少我的实现被锁定。由于大部分时间都花在rand 上,因此您的代码会严重扩展。解决方案是通过rand_r 使用显式线程私有状态。 (另见this question)。

拼凑起来,修改后的代码如下:

double int_mcnd(double (*fn)(double[], int), double a[], double b[], int n, int m)

    // Reduction variables need to be shared
    double r = 0.0;
    double v = 1.0;

    #pragma omp parallel
    // All variables declared inside are private
    
        // step 1: calculate the common factor V
        #pragma omp for reduction(* : v)
        for (int j = 0; j < n; j = j + 1)
        
            v = v * (b[j] - a[j]);
        

        // step 2: integration
        unsigned int private_seed = omp_get_thread_num();
        #pragma omp for reduction(+ : r)
        for (int i = 1; i <= m; i = i + 1)
        
            // Note: X MUST be private, otherwise, you have race-conditions again
            double x[n];
            // calculate random x[] points
            for (int j = 0; j < n; j = j + 1)
            
                x[j] = a[j] + (rand_r(&private_seed)) / ((RAND_MAX / (b[j] - a[j])));
            
            r = r + fn(x, n);
        
    
    r = r * v / m;

    return r;


double f(double[], int);
double int_mcnd(double (*)(double[], int), double[], double[], int, int);

int main(int argc, char** argv)


    /* define how many integrals */
    const int n = 10;

    double b[n] =  5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0, 5.0 ;
    double a[n] =  -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0, -5.0 ;

    int m;

    unsigned long long int i, N;
    int NumThreads = 4;

    // initial seed value (use system time)
    srand(time(NULL));

    cout.precision(6);
    cout.setf(ios::fixed | ios::showpoint);

    // current time in seconds (begin calculations)
    time_t seconds_i;
    seconds_i = time(NULL);

    m = 4; // initial number of intervals

    // convert command-line input to N = number of points
    N = atoi(argv[1]);

    for (i = 0; i <= N / pow(4, i); i++)
    
        double result = int_mcnd(f, a, b, n, m);
        double mean = result / (pow(10, 10));
        cout << setw(30) << m << setw(30) << result << setw(30) << mean << endl;
        m = m * 4;
    

    // current time in seconds (end of calculations)
    time_t seconds_f;
    seconds_f = time(NULL);
    cout << endl << "total elapsed time = " << seconds_f - seconds_i << " seconds" << endl << endl;

    return 0;

请注意,我删除了除以四,并且输出是在并行区域之外完成的。结果应该与串行版本相似(当然随机性除外)。

我观察到在使用 -O3 的 16 核系统上实现了完美的 16 倍加速。

补充几点:

尽可能在本地声明变量。

如果线程开销会成为问题,您可以将并行区域移到外部,但是您需要更仔细地考虑并行执行,并找到共享归约变量的解决方案。鉴于 Monte Carlo 代码具有令人尴尬的并行特性,您可以通过删除 omp for 指令更紧密地坚持初始解决方案 - 这意味着每个线程都执行 all 循环迭代。然后你可以手动总结结果变量并打印出来。但我真的不明白这一点。

【讨论】:

我仍在学习曲线中,非常感谢您的详细说明【参考方案2】:

我不会详细介绍,但会给出一些建议

以这部分代码为例:

// step 1: calculate the common factor V
#pragma omp for
for (j = 0; j < n; j = j+1)
  
     v = v*(b[j]-a[j]);
   

如果您查看变量 v ,则很明显存在竞争条件。也就是说,您必须将 v 声明为线程私有(可能称为 local_v),然后通过归约操作将所有值收集到 global_v 值中。

一般来说,我建议您为 openmp 寻找竞争条件、关键区域、共享和私有内存的概念。

【讨论】:

虽然我只能支持您的一般建议,但特定变量 v 已经是私有的,因为它是在函数外部的 parallel 区域内声明的。

以上是关于与 openmp 的 10 维蒙特卡罗集成的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

蒙特卡洛与 Python 的集成

NodeJS:具有多线程的本机 C++ 模块(openmp)

使用非线程安全随机数生成器在 C 中为 pi monte carlo 更正 OpenMP 编译指示

Matlab 蒙特卡罗积分循环

蒙特卡罗马尔科夫与吉布斯采样

秘籍首发!可靠性设计分析与 CAE 如何一体化集成?