R corrplot colorlegend 变化范围

Posted 2023-02-16

【中文标题】R corrplot colorlegend 变化范围

【英文标题】：R corrplot colorlegend change range

【发布时间】：2015-03-22 11:26:48

【问题描述】：

我正在尝试使用 corrplot 包在 R 中绘制相关矩阵。 我的问题是整个矩阵的最小和最大相关系数的范围是（-0.2,0.2）。我用corrplot 绘制矩阵，并使用自定义colorRampPalette，比如

col1<-colorRampPalette(c('red','yellow','green','blue'))

对于图例的颜色图，所以我设置了col=col1(10)，我设置了cl.lim=c(-0.2,0.2)。

当我看到绘图时，colorlegend 出现在 -0.2 到 0.2 之间，但只有 2 种颜色，而我想要的是一个 colorlegend，其中包含自定义调色板的 10 个 bin 中的整个色谱但在范围内（-0.2 ,0.2) 所以我将有 10 种颜色，而不是只有 2 种颜色。

【问题讨论】：

你找到解决办法了吗？

【参考方案1】：

解决方案是复制颜色范围，所以，得到下半部分......

mypal = jet.colors(1000) # jet.colors from library(matlab)

color = c(mypal,mypal)

corrplot(M, col=color)

【参考方案2】：

我遇到了类似的问题，但相关性大多非常高。如果不在我的调色板中定义大量未使用的颜色，就很难区分不同的点。

我的解决方案是在绘图之前将我的相关性重新调整到(-1, 1) 的范围（这是corrplot 假定的范围）：

corrplot2 <- function(corr, col) 
    a = 2 / (max(corr) - min(corr))
    b = 1 - (2 / (1 - (min(corr) / max(corr))))
    y = a * corr + b
    corrplot(y, method="circle", bg="grey92", col=col, 
             order="hclust", addrect=4, cl.lim=c(-1, 1))

这样，使用我选择的颜色col，可以再次很好地区分值的整个分布。