使用 for 循环保存多个 ggplots

Posted 2023-02-24

【中文标题】使用 for 循环保存多个 ggplots

【英文标题】：Save multiple ggplots using a for loop

【发布时间】：2014-11-19 23:11:51

【问题描述】：

我想自动生成一些 ggplots：

通用数据集：

mydata<-data.frame(matrix(rnorm(100),ncol=5))
names(mydata)<-c("Tijd","X1","X2","X3","X4") 

指定要包含的变量：

Start=2
Stop=5

要保存绘图的列表：

gvec<-vector("list",length=length(Start:Stop))

创建绘图：

for(i in Start:Stop)
  graphy<-ggplot(mydata,aes_string(x="Tijd",y=names(mydata)[i]))+geom_point()+mytheme
  gvec[[i-Start+1]]<-graphy

保存地块：

for(i in Start:Stop)
tiff(paste0("Test/Residu/Plots/Prei/mydata.",names(mydata)[i],"09.14.tiff"),width=720,height=720)
gvec[[i-Start+1]]
graphics.off()

地块列表生成；我也可以手动保存图。但是，使用最后一个循环生成的文件都是空白的。我无法弄清楚这其中的原因。

按照罗兰的建议，我试过了 print(gvec[[i-Start+1]]) 但我仍然得到空白文件作为输出。

【问题讨论】：

print(gvec[[i-Start+1]])

似乎没有这样做。仍然是空白文件。

您需要显式调用print 以绘制到设备（这就是Roland 所说的）。

我刚刚运行了你的代码，它对我有用。它产生 4 个 tiff 文件（当 print 函数按照建议添加到您的最终循环时）。

【参考方案1】：

您还可以使用ggplot2 库中的ggsave 函数。

library(ggplot2)
data("iris")

# list of values to loop over
  uniq_species = unique(iris$Species)


# Loop

for (i in uniq_species) 

  temp_plot = ggplot(data= subset(iris, Species == i)) + 
                  geom_point(size=3, aes(x=Petal.Length, y=Petal.Width )) +
                  ggtitle(i)

  ggsave(temp_plot, file=paste0("plot_", i,".png"), width = 14, height = 10, units = "cm")

【参考方案2】：

您可以在同一个循环中创建和导出绘图。合并后的代码是：

for(i in Start:Stop)
  graphy<-ggplot(mydata,aes_string(x="Tijd",y=names(mydata)[i]))+geom_point()+mytheme
  tiff(paste0("Test/Residu/Plots/Prei/mydata.",names(mydata)[i],"09.14.tiff"),width=720,height=720)
  print(graphy)
  dev.off()  

对于堆叠数据的一般情况，其中id 变量对应于子组（国家、个人等））：

for (i in 1:10) 
  mydata_id <- subset(mydata, id == i) # subselect group
  p <- ggplot(mydata_id, aes(x, y)) + geom_line() # create graph
  png(paste("plot_", i, ".png", sep = ""), width=600, height=500, res=120) # start export
  print(p) 
  dev.off() # finish export

【参考方案3】：

这是一个在循环中创建 ggplots 的完全可重现的示例。

# Plot separate ggplot figures in a loop.
library(ggplot2)

# Make list of variable names to loop over.
var_list = combn(names(iris)[1:3], 2, simplify=FALSE)

# Make plots.
plot_list = list()
for (i in 1:3) 
    p = ggplot(iris, aes_string(x=var_list[[i]][1], y=var_list[[i]][2])) +
        geom_point(size=3, aes(colour=Species))
    plot_list[[i]] = p


# Save plots to tiff. Makes a separate file for each plot.
for (i in 1:3) 
    file_name = paste("iris_plot_", i, ".tiff", sep="")
    tiff(file_name)
    print(plot_list[[i]])
    dev.off()


# Another option: create pdf where each page is a separate plot.
pdf("plots.pdf")
for (i in 1:3) 
    print(plot_list[[i]])

dev.off()