CompileError/LinkerError: "command 'gcc' failed with exit status 1" 是啥意思，在 IPython 中运行 %%c

Posted 2023-02-23

【中文标题】CompileError/LinkerError: "command \'gcc\' failed with exit status 1" 是啥意思，在 IPython 中运行 %%cython-magic 单元时

【英文标题】：What does CompileError/LinkerError: "command 'gcc' failed with exit status 1" mean, when running %%cython-magic cell in IPythonCompileError/LinkerError: "command 'gcc' failed with exit status 1" 是什么意思，在 IPython 中运行 %%cython-magic 单元时

【发布时间】：2019-08-30 12:25:14

【问题描述】：

有时，当我在 IPython 笔记本中运行 %%cython-cell 时，我会得到一个很长的回溯，并以非常短的错误消息结尾：

CompileError: command 'gcc' failed with exit status 1

或

LinkError: 命令“gcc”失败，退出状态为 1

在 Windows 上相应的消息是：

CompileError: command 'C:.\Microsoft Visual Studio\..\cl.exe' 失败，退出状态为 X

和

LinkError：命令 'C:..\Microsoft Visual Studio\..\link.exe' 失败，退出状态为 YYYY

是否可以获得有关潜在错误的更精确信息？

这样的 %%cython-cell 示例如下：

[1] %load_ext Cython
[2] %%cython
    from sklearn.tree._tree cimport Node
    print("loaded")

【问题讨论】：

我对此表示赞成，因为如果没有赞成的答案，它就不能成为重复的目标（我怀疑这是你的意图）

@DavidW 谢谢，我不认为它会成为一个很好的欺骗目标，因为问题每次都会有所不同，但在 cmets 中解释这一点非常乏味。并不是说这个问答到目前为止效果很好......

【参考方案1】：

%%cython 魔法使用distutils 在底层构建 Cython 扩展，而 IPython不会捕获输出 gcc 或其他编译器/链接器日志到标准错误/输出。

要查看编译器/链接器记录的错误和警告，必须转到编译器记录错误的位置，这取决于 IPython 的启动方式。

在 Linux 上还有另一种可能性：安装 wurlitzer 软件包并通过 %load_ext wurlitzer 激活它，这也将捕获 gcc 的输出并将其显示在笔记本中，另请参阅 this answer。

遗憾的是，wurlitzer 仅适用于 Linux，而下面的选项适用于任何操作系统。

IPython/Jupiter 笔记本：

当笔记本从终端启动时，例如通过ipython notebook 或类似方式，然后可以在此终端中看到编译器输出 - 我们看到上述单元格的问题是：

/home/ed/.cache/ipython/cython/_cython_magic_5f6d267a6f541c572b4517a74d5c9aad.c:607:31: 致命错误：numpy/arrayobject.h：没有这样的文件或目录 编译终止。

缺少 numpy-headers，可在 numpy.get_include() 中找到。

IPython 控制台

如果 IPython 从终端启动，错误会直接记录到 IPython 控制台。但请注意：编译器/链接器输出将直接出现在错误跟踪的开头：

 >>> ipython
Python 3.7.3 (default, Mar 27 2019, 22:11:17) 
Type 'copyright', 'credits' or 'license' for more information
IPython 7.4.0 -- An enhanced Interactive Python. Type '?' for help.                                                                       

In [1]: %load_ext Cython                                                        

In [2]: %%cython 
   ...: from sklearn.tree._tree cimport Node 
   ...: print("loaded") 
   ...:  
   ...: 
/home/ed/.cache/ipython/cython/_cython_magic_1182f410e5c0a56b03b28dd88700704d.c:607:31: fatal error: numpy/arrayobject.h: No such file or directory
compilation terminated.
---------------------------------------------------------------------------
DistutilsExecError                        Traceback (most recent call last)
....

CompileError: command 'gcc' failed with exit status 1

第一行告诉我们需要知道的一切！

Spyder：

至少从 Spyder 3.3.3 开始，编译器/链接器的输出可以在 IPython 控制台中看到（与在独立的 IPython 控制台中相同）。

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示例 %%cython-cell 可以固定如下：

%%cython -I <path from numpy.get_include()>
from sklearn.tree._tree cimport Node
print("loaded")