skbio 安装验证

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【中文标题】skbio 安装验证【英文标题】:verification of installation of skbio 【发布时间】:2020-12-01 15:46:58 【问题描述】:

我在 Windows 10 中安装了 Scikit-bio python 模块。 安装后,我通过运行python -m skbio.test验证安装

我得到以下结果(消息的结尾部分)

ERROR AppData/Local/Programs/Python/Python37/lib/site-packages/skbio/io/tests/test_util.py::TestWriteBufferedReader::test_open_gzip - PermissionE...

错误 AppData/Local/Programs/Python/Python37/lib/site-packages/skbio/io/tests/test_util.py::TestWriteBufferedReader::test_open_gzip_encoding - Pe... ================================ 220失败,2324通过,30秒,4856警告,318.73s的8个错误​​( 0:05:18) =================================

好像有些东西没有安装好。。我的安装是不是有问题? 希望得到答复 谢谢。

【问题讨论】:

【参考方案1】:

如果您使用 pip 安装它,请尝试卸载它并改用 conda,按照其 pypi.org 说明。这也可能是您的操作系统的问题。另外,请尝试验证是否安装了 numpy。

【讨论】:

以上是关于skbio 安装验证的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

尝试导入 skbio 模块时未找到 future.utils.six

如何获得`skbio` PCoA(主坐标分析)结果?

带有 skbio 的二维 PCoA 图

在 skbio 中打开文件句柄以与 TabularMSA 一起使用

使用 skbio 从压缩的 FASTA bz2 文件中读取

当 `skbio 的 pcoa` 不是时,为啥 `sklearn.manifold.MDS` 是随机的?