致命错误：mpi.h：没有这样的文件或目录#include <mpi.h>

Posted 2023-02-21

【中文标题】致命错误：mpi.h：没有这样的文件或目录#include <mpi.h>

【英文标题】：fatal error: mpi.h: No such file or directory #include <mpi.h>

【发布时间】：2015-01-11 06:13:51

【问题描述】：

当我只用编译我的脚本时

#include <mpi.h>

它告诉我没有这样的文件或目录。 但是当我将 mpi.h 的路径包含为

#include "/usr/include/mpi/mpi.h"

（路径正确）返回：

In file included from /usr/include/mpi/mpi.h:2087:0,
                 from lbm.cc:7:
/usr/include/mpi/openmpi/ompi/mpi/cxx/mpicxx.h:35:17: fatal error: mpi.h: No such file or directory
 #include "mpi.h"
                 ^
compilation terminated.

有人知道如何解决这个问题吗？

【问题讨论】：

你的编译器和操作系统是什么？

g++ 在 Linux 上。并且 也不起作用。

使用消息传递接口的程序应该使用mpicc main.c -o main或mpiCC main.cpp -o main之类的东西来编译。是你的情况吗？关于第二条消息：您的计算机上可能有两种 MPI 标准的实现。您可以通过输入which mpicc、which mpirun、mpirun --version 或module avail 来尝试了解更多信息。编译器命令的实现（openmpi 或 mpich2 或...）必须与执行程序的命令mpirun -np 2 main 相同。

【参考方案1】：

问题几乎可以肯定是您没有使用 MPI 编译器包装器。无论何时编译 MPI 程序，都应该使用 MPI 包装器：

C-mpicc C++ - mpiCC, mpicxx, mpic++ FORTRAN - mpifort, mpif77, mpif90

这些包装器为您完成所有繁琐的工作，确保在您编译程序时包含所有适当的编译器标志、库、包含目录、库目录等。

【讨论】：

难题在于 openmpi 没有 mpicc、mpicxx 等的 MPI 包装器。

可能有一些实现不提供它们，但 Open MPI 不是其中之一。它肯定至少有mpicc 和mpicxx 和mpifortan。

你能解释一下如何解决这个问题吗？我正在尝试制作某人的程序，它在原始帖子中给出了错误。它正在寻找 mpi.h。我使用 apt-get 安装了 api。仍然得到同样的错误。

没有提供有关如何使用这些包装器的信息；像-mpiCC一样将它们添加到编译器中，安装包装器并将其包含在源文件中？

@user391339 和 Romario 默认情况下，您的 IDE 使用 cmake 左右来编译 .cpp 文件，对吗？.. 相反，您将使用 mpi 包装器（它只是一个编译/执行命令）来编译/执行你的程序。一个例子是：$ mpic++ main.cpp，一个运行你的程序的例子是 $ mpirun -np 2 a.out

【参考方案2】：

在我的系统上，我只是缺少 Linux 软件包。

sudo apt install libopenmpi-dev
pip install mpi4py

（使用它的例子是一个很好的即时测试，看看它是否成功）

成功了。

【参考方案3】：

你可以执行：

$ mpicc -showme 

结果：

gcc -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -L/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/lib -lmp

此命令显示编译 mpicc 所需的库

例子：

$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o [nameExec] [objetcs.o...] [program.c] -lm


$ mpicc -g  -I/Users/<USER_NAME>/openmpi-2.0.1/include -o example file_object.o my_program.c otherlib.o -lm

这个命令在你的例子中生成可执行文件，你可以执行：

$ ./example

【讨论】：

您是否建议使用包装器来提取一些信息，然后再次将其传递给包装器？

【参考方案4】：

在我的系统 Ubuntu 16.04 上。我安装了：

sudo apt install libopenmpi-dev

我用mpiCC编译后就可以了

【参考方案5】：

如上所述，包含

/usr/lib/openmpi/include 

在包含路径中处理这个（在我的情况下）

【讨论】：

/usr/lib64/mp​​i/gcc/openmpi/include/ 用于 OpenSUSE Leap

【参考方案6】：

Debian 似乎包含以下内容：

mpiCC.openmpi mpic++.openmpi mpicc.openmpi mpicxx.openmpi mpif77.openmpi mpif90.openmpi

我将为 mpic 等测试每个符号链接，看看这是否有助于启用 HDF5-openmpi 之类的找到 mpi.h。

让 Debian 通过他们的替代系统包含符号链接，它仍然无法找到 HDF5 openmpi 包和 H5public.h 标头中引用的 mpi.h 之间的正确路径。

【参考方案7】：

在 Ubuntu 18.04 上我必须安装：

sudo apt install lam4-dev

【讨论】：

林中古。不要使用它。使用 Open-MPI 3+ 或 MPICH 3+。

【参考方案8】：

在 Fedora 上：

dnf install openmpi-devel