如何处理 Shiny App 部署中的文件计数超出限制错误 [关闭]

Posted 2023-02-19

【中文标题】如何处理 Shiny App 部署中的文件计数超出限制错误 [关闭]

【英文标题】：How to handle file count excesses limit error in Shiny App deployment [closed]

【发布时间】：2022-01-13 05:19:45

【问题描述】：

我有一个包含大量文件的 Shiny 应用程序。当我点击rsconnect::deplopApp时遇到以下错误：

Error: Unhandled Exception: Child Task 1063039276 failed: Error parsing manifest: Manifest file count (220625) greater than the maximum allowed (6000)

所有文件都是.RData，它们不能即时计算，因为它会占用大量时间。我试过parallel 和doParallel，但在shinyapp.io 上getDoParRegistered() 在成功部署后总是FALSE。

这个问题有什么更好的主意吗？谢谢。

【问题讨论】：

将 .RData 文件压缩到一个存档中。删除 .Rdata 文件。让应用程序在启动时测试 zip 文件是否存在。如果zip文件存在，解压然后删除。

您也可能会遇到这么多文件的存储限制。在这种情况下，您可能需要考虑将数据单独托管到应用程序中，然后根据需要采用某种方法远程访问数据。

访问文件也很慢，尤其是当您拥有数千个文件时。也许将 R 对象存储在安装的数据库中。然后，由于索引，查找也更快。

【参考方案1】：

解决方案比我想象的要容易得多：不需要数据库，只需创建一个巨大的.RData，它本质上是一个嵌套列表。嵌套方式根据目录结构而定。

我探索了 SQLite 的选项，它也非常适合此目的，但 .RData 方法更简单。