使用 R 对大型数据集进行变量/降维
Posted
技术标签:
【中文标题】使用 R 对大型数据集进行变量/降维【英文标题】:Using R for variable/dimension reduction on large data set 【发布时间】:2011-10-05 03:48:39 【问题描述】:我在 R 中有一些数据,其中包含适用于我的案例的各种变量:
B T H G S Z
Golf 1 1 1 0 1 0
Football 0 0 0 1 1 0
Hockey 1 0 0 1 0 0
Golf2 1 1 1 1 1 0
Snooker 1 0 1 0 1 1
我也有每个案例的预期输出向量:
1、2、3、1、4
我想做的是识别无用的变量。在这个例子中,B 和 Z 几乎没有能力对数据进行分类,所以我想知道这个事实。
我研究过使用多元线性回归,但是我不想单独输入和操作每个变量/维度,因为在我的正确数据中它会遇到成千上万个案例。
任何关于最佳方法的帮助将不胜感激。
顺便说一句,我不是统计学家,我是软件开发人员,如果术语不正确,请见谅。
【问题讨论】:
【参考方案1】:您提出了一个相当广泛的问题,但我会尽量做到准确。但请注意:每种统计分析方法都有一系列隐含的假设。这意味着,如果您在不了解分析局限性的情况下依赖统计模型的结果,您很容易得出错误的结论。
我也不太清楚你所说的分类是什么意思。如果有人让我做分类分析,我可能会考虑聚类分析、因子分析或潜在类别分析。有一些线性回归模型的变体也可以适用。
也就是说,您应该如何使用您的数据进行线性回归。
首先,复制您的样本数据:
dat <- structure(list(B = c(1L, 0L, 1L, 1L, 1L), T = c(1L, 0L, 0L, 1L,
0L), H = c(1L, 0L, 0L, 1L, 1L), G = c(0L, 1L, 1L, 1L, 0L), S = c(1L,
1L, 0L, 1L, 1L), Z = c(0L, 0L, 0L, 0L, 1L)), .Names = c("B",
"T", "H", "G", "S", "Z"), class = "data.frame", row.names = c("Golf",
"Football", "Hockey", "Golf2", "Snooker"))
dat
B T H G S Z
Golf 1 1 1 0 1 0
Football 0 0 0 1 1 0
Hockey 1 0 0 1 0 0
Golf2 1 1 1 1 1 0
Snooker 1 0 1 0 1 1
接下来,添加预期值:
dat$expected <- c(1,2,3,1,4)
dat
B T H G S Z expected
Golf 1 1 1 0 1 0 1
Football 0 0 0 1 1 0 2
Hockey 1 0 0 1 0 0 3
Golf2 1 1 1 1 1 0 1
Snooker 1 0 1 0 1 1 4
最后,我们可以开始分析了。幸运的是,lm
有一个快捷机制来告诉它使用数据框中的所有列。为此,请使用以下公式:expected~.
:
fit <- lm(expected~., dat)
summary(fit)
Call:
lm(formula = expected ~ ., data = dat)
Residuals:
ALL 5 residuals are 0: no residual degrees of freedom!
Coefficients: (2 not defined because of singularities)
Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)
(Intercept) 2.00e+00 NA NA NA
B 1.00e+00 NA NA NA
T -3.00e+00 NA NA NA
H 1.00e+00 NA NA NA
G -4.71e-16 NA NA NA
S NA NA NA NA
Z NA NA NA NA
Residual standard error: NaN on 0 degrees of freedom
Multiple R-squared: 1, Adjusted R-squared: NaN
F-statistic: NaN on 4 and 0 DF, p-value: NA
最后一句要小心。由于您的样本数据包含的行数少于列数,因此线性回归模型没有足够的数据来运行。所以在这种情况下,它只是丢弃了最后两列。您对数据的简短描述似乎表明您有更多的行和列,所以这对您来说应该不是问题。
【讨论】:
感谢您的详尽回答。我自己试过了,它看起来很符合我的需要。我的差距是不知道如何在数据帧上使用 lm。我所说的“分类”是指变量在预测期望值方面很差。【参考方案2】:有很多不同的方法需要考虑。一个基本的起点是进行主成分回归(http://rss.acs.unt.edu/Rdoc/library/pls/html/svdpc.fit.html 就是一个例子)。 很多悬而未决的问题——你期望什么分布,这些变量是否总是布尔值,或者它们是否代表人口统计切片的年龄或枚举值。
https://stats.stackexchange.com/ 有很多这类问题的专家。
【讨论】:
谢谢,我一定要试试。以上是关于使用 R 对大型数据集进行变量/降维的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章
R语言使用psych包的principal函数对指定数据集进行主成分分析PCA进行数据降维(输入数据为原始数据)使用nfactors参数指定抽取的主成分的个数principal函数结果解读
R语言使用psych包的principal函数对指定数据集进行主成分分析PCA进行数据降维(输入数据为相关性矩阵)计算主成分评分系数每个样本(观察)的主成分得分由主成分分数系数构建的公式得到
Python数据集可视化:抽取数据集的两个特征进行二维可视化主成分分析PCA对数据集降维进行三维可视化(更好地理解维度之间的相互作用)