根据第二个矩阵的条件将矩阵的值转换为1或0
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【中文标题】根据第二个矩阵的条件将矩阵的值转换为1或0【英文标题】:Convert value of matrix to 1 or 0 based on the conditions of the second matrix 【发布时间】:2022-01-15 10:24:06 【问题描述】:我有两个矩阵,您可以在下面看到:
第一个矩阵是我的实际数据收集字段。只是最后一列(组)是样本的组分类数(例如样本 1 和 3 属于组 1),其他列是物种的值。我想将每个样本中的物种值转换为数字one
,如果它具有第二个矩阵的条件,如果它没有第二个矩阵的条件,则转换为zero
。
matrix (1)
A B C D Group
1 5 1 6 1 1
2 4 4 5 8 2
3 1 4 3 4 1
4 0 2 7 5 3
5 8 4 3 1 3
matrix (2)
Group1 Group2 Group3
A 1 0 0
B 1 1 0
C 0 0 1
D 1 1 1
我想要的新矩阵如下
new matrix
A B C D
1 1 1 0 1
2 0 1 0 1
3 1 1 0 1
4 0 0 1 1
5 0 0 1 1
为了更好地理解新矩阵,我举个例子: 例如,由于物种 A 仅存在于第 1 组中(矩阵 (2) 中存在 1,而矩阵 (2) 中不存在 0),因此其值在样本 1 和 3 中变为 1,而在其他样本中变为 0,或者对于物种 D,因为它是存在于所有组中,所有样本的值为1。
【问题讨论】:
【参考方案1】:这是另一种方法:
df2mask <- t(df2)[df1$Group, ]
df2mask
# A B C D
# Group1 1 1 0 1
# Group2 0 1 0 1
# Group1 1 1 0 1
# Group3 0 0 1 1
# Group3 0 0 1 1
dfnew <- ifelse(df1[, -5] * df2mask > 0, 1, 0)
dfnew
# A B C D
# 1 1 1 0 1
# 2 0 1 0 1
# 3 1 1 0 1
# 4 0 0 1 1
# 5 0 0 1 1
请注意,掩码和最终矩阵是相同的,因为您的示例不包含任何不存在物种但掩码值为 1 的单元格。
【讨论】:
【参考方案2】:df1%>%
rownames_to_column('ID')%>%
pivot_longer(-c(ID, Group), names_to = 'rn', values_to = 'val1') %>%
left_join(df2%>%
rownames_to_column('rn') %>%
pivot_longer(-rn, names_pattern = '(\\d)$',
names_to = 'Group',
names_transform = list(Group = as.integer)))%>%
pivot_wider(ID, names_from = 'rn', values_from = 'value')
# A tibble: 5 x 5
ID A B C D
<chr> <int> <int> <int> <int>
1 1 1 1 0 1
2 2 0 1 0 1
3 3 1 1 0 1
4 4 0 0 1 1
5 5 0 0 1 1
数据
df1 <- structure(list(A = c(5L, 4L, 1L, 0L, 8L), B = c(1L, 4L, 4L, 2L,
4L), C = c(6L, 5L, 3L, 7L, 3L), D = c(1L, 8L, 4L, 5L, 1L), Group = c(1L,
2L, 1L, 3L, 3L)), class = "data.frame", row.names = c("1", "2",
"3", "4", "5"))
df2 <- structure(list(Group1 = c(1L, 1L, 0L, 1L), Group2 = c(0L, 1L,
0L, 1L), Group3 = c(0L, 0L, 1L, 1L)), class = "data.frame", row.names = c("A",
"B", "C", "D"))
【讨论】:
以上是关于根据第二个矩阵的条件将矩阵的值转换为1或0的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章