将 .RData 保存在不同的目录中

Posted 2023-05-07

【中文标题】将 .RData 保存在不同的目录中

【英文标题】：Save .RData in a different directory

【发布时间】：2021-04-23 08:17:52

【问题描述】：

我从特定文件夹加载我的文件 (.RData)，并创建了一个子文件夹来保存一些示例和子集。所以，我想将这些元素保存在子文件夹中，并且它们没有相同的名称结构，因为我有多个数据集（例如它不能是 sub1、sub2 等，我必须编写 try1、full_sample、sub_2021 等等)。

我尝试了以下方法：

subsets_samples <- file.path <-("/Volumes/WD_BLACK/Merge/SAMPLES_SUBSETS")
fname <- file.path(subsets_samples, ".RData")
save(mydata, file=fname)

但显然保存部分有问题。我的目标是拥有类似的东西：

save(mydata, file = "newname")

使用自动放入的 fname 中的 .RData 格式。

我看到了一些带有循环等的答案，但我不太了解这个过程，对不起。

谢谢！

【参考方案1】：

file.path 的问题在于它会在每个元素之间放置一个分隔符（例如，/¸）。因此，除了实际文件名之外，您还必须使用 paste0：

# If I understand you correctly, you want the iteration, like try1, full_sample, sub_2021 and so on in your file name. define them somewhere in your loop/script
iteration <- "full_sample"
fname <- file.path("Volumes", "WD_BLACK", "Merge", "SAMPLES_SUBSETS", paste0(iteration, ".Rds"))

另外，我建议使用saveRDS 而不是save，因为如果您只想保存一个对象，它是合适的函数。

saveRDS(mydata, file = fname)

【讨论】：

好吧，例如，如果我的子集在我的全局环境中被命名为“sample2021”，我希望它在我的“SAMPLES_SUBSETS”子文件夹中保存为“sample_2021.RData”（或 .Rds）。此外，我有来自多个数据集的多个子集，因此在我的 GE 中可以将另一个子集命名为“supply_y1”，依此类推。这是您的代码的结果：“错误：无法打开压缩文件'Volumes/WD_BLACK/MSI/SAMPLES_SUBSETSfull_sample.Rds'，可能的原因：'没有这样的文件或目录'

对不起，我的错。我以前从未真正遇到过file.path。现在应该可以工作了。

现在路径和文件名看起来正确。你的电脑上有这样的文件夹吗？

当我做 saveRDS(sample2021, file=fname) 时，我得到这个：'Volumes/WD_BLACK/MSI/SAMPLES_SUBSETS/full_sample.Rds'，：'没有这样的文件或目录'；实际上，我不理解“迭代”行，我只想将全局环境中的内容保存在文件夹“SAMPLES_SUBSETS”中，而不是名称为“full_sample”。我的意思是，当我在发布消息之前在 Stack 上查看这个问题时，我只看到这个主题的数据集具有相同的结构：“sub1，sub2”等等，这使得它们的循环无法为我工作我每次都有不同的结构。

比如，一个我的样本是“full_sample”，另一个是“p1”，另一个是“suppliers_21”等等，名称中没有共同的结构。