Gephi：根据稀疏有向图中的权重为节点着色

Posted 2023-04-18

【中文标题】Gephi：根据稀疏有向图中的权重为节点着色

【英文标题】：Gephi: Color Nodes according to a weight in a sparse directed graph

【发布时间】：2017-03-26 19:22:16

【问题描述】：

我想使用 Gephi 来可视化一个大型的稀疏图（它大约有 876,000 个节点，旨在模拟“互联网”以测试页面排名算法）。

问题是：我已经计算了图中节点的页面排名（将它们视为“网站”）。

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现在，我需要将数据输出到 CSV 中，以便 Gephi 可以读取它......我想根据热图/颜色图为节点着色，为它们提供与其页面排名相对应的颜色.

所以，我需要一个图表，让每个顶点都有一个权重，然后适当地为图表着色。

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Gephi 的新手，我正在查看website：它描述了如何以邻接矩阵格式存储边权重，但我的图对于存储为邻接矩阵来说太大了。如果我将其存储为邻接列表，我看不到存储边权重或节点权重的方法。链接中描述的格式是：

> a;b;c;d   

相当于：节点“a”与“a->b”、“a->c”和“a->d”。但是，格式中似乎没有节点权重或边权重的插槽。

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是否可以使用 Gephi 来显示我所描述的图表（节点根据其权重着色）以及，如果可以，我将如何将 Gephi 的图表存储到读？

【问题讨论】：

取得进展。找到了一个着色节点的插件；会想出一种方法，根据颜色图或其他东西将权重转换为好的十六进制颜色，并发布一个“如何做”。

【参考方案1】：

我认为您所指的页面可能已过时。在this page 上，他们提到了两种类型的 CSV：边表与节点表。

因此，您可以生成两个不同的 CSV 文件：

一个包含与链接对应的节点对的边表，如果有的话，可能是权重。 一个节点表，其中包含图表中的节点列表，以及它们具有的任何属性，包括您的 PageRank 值。