SciPy 无法通过 pip 安装

Posted 2023-04-14

【中文标题】SciPy 无法通过 pip 安装

【英文标题】：SciPy fails to install via pip

【发布时间】：2016-05-18 21:19:32

【问题描述】：

我尝试在SLURM 环境中使用 pip 安装 SciPy。 NumPy 和其他一些 python 模块已经安装并且工作正常。

但是，当我运行时：

pip2.7 install --user --use-wheel scipy

或

pip2.7 安装 --user scipy

我总是收到一堵巨大的文字墙，结尾是：

错误：命令“/sw/compiler/gcc-4.9.3/bin/gfortran -Wall -g -shared -Wall -g -shared -shared build/temp.linux-x86_64-2.7/scipy/integrate/_odepackmodule.o -L/sw/env/gcc-4.9.3_openmpi-1.8.8/pkgsrc/2015Q4/lib -L/sw/env/gcc-4.9.3_openmpi-1.8.8/pkgsrc/2015Q4/lib -Lbuild/temp.linux -x86_64-2.7 -lodepack -lmach -llapack -lblas -lpython2.7 -lgfortran -o build/lib.linux-x86_64-2.7/scipy/integrate/_odepack.so”失败 退出状态 1

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命令“/sw/env/gcc-4.9.3_openmpi-1.8.8/pkgsrc/2015Q4/bin/python2.7 -c “导入设置工具， tokenize;file='/work/tmp/node001.admin.2016-02-09-015538.intx033.31602/pip-build-fORQns/scipy/setup.py';exec(compile( getattr（标记化， 'open', open)(file).read().replace('\r\n', '\n'), file, 'exec'))" 安装 --record /work/tmp/node001.admin.2016-02-09-015538.intx033.31602/pip-7oTcK5-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --user --prefix=" 失败，错误代码为 1 /work/tmp/node001.admin.2016-02-09-015538.intx033.31602/pip-build-fORQns/scipy

很遗憾，我不知道这应该告诉我什么……有什么想法吗？

【问题讨论】：

当 scipy 安装失败但其他包安装失败时，通常是 gfortran、LAPACK 或 BLAS 有问题。不熟悉 Slurm，但如果没有其他人对您有任何更具体的建议，我建议确保这些设置正确。

好的，谢谢。您是否有任何链接/文档具体说明需要哪些 gfortran、LAPACK 和 BLAS 包？以及哪些版本？

我不认为它过于挑剔。此处文档的开头提供了一些指导，并且大部分过程都有详细信息：scipy.org/scipylib/building/linux.html

【参考方案1】：

您需要有 C、C++ 和 fortran 编译器以及 BLAS/LAPACK 库来编译 scipy。最简单的选择可能是 gcc+gfortran+prebuilt atlas，它应该可以工作。对于性能，尤其是线性代数，您可能需要考虑使用 intel MKL 或 OpenBLAS。

【参考方案2】：

我建议不要使用 gfortran 包，而是通过科学包安装 scipy： Python XY Anaconda (supports virtual env)