如何为 Apache Beam 中 Avro SpecificRecordBase 的所有子类选择单个编码器?

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【中文标题】如何为 Apache Beam 中 Avro SpecificRecordBase 的所有子类选择单个编码器?【英文标题】:How to select a single encoder for all subclass of Avro SpecificRecordBase in Apache Beam? 【发布时间】:2020-06-14 20:52:06 【问题描述】:

背景

My Beam Pipeline 旨在处理 Avro SpecificRecordBase 类型的元素。

为了简化我的问题,假设我有两种以 Avro 格式生成的元素,它们都有自己的字段:

class Dog extends SpecificRecordBase 
    ....


class Cat extends SpecificRecordBase 
   ...

Pipeline 将从输入 Kafka 中读取元素,处理元素并将处理后的元素放入输出 Kafka,如下所示:

Pipeline pipeline = Pipeline.create(getOptions());
pipeline.getCoderRegistry().registerCoderForClass(SpecificRecordBase.class, <what shall I put here?>);

pipeline.apply(kafkaReaderTransformer)
              .apply(Window.into(FixedWindows.of(Duration.standardSeconds(getWindowSize()))))
                .apply(GroupByKey.create())
                .apply(ParDo.of(GiveShowerToPetDoFn))
                .apply(Flatten.iterables())
                .apply(kafkaWriterTransformer);

问题

我的问题是如何在管道中注册编码器? 由于管道可以从 Cat Kafka 或 Dog Kafka 中读取,将来可能还会从 Toad Kafka 中读取,我需要一种通用的方法来注册编码器,该编码器可以序列化在运行时决定的 SpecificRecordBase 的所有子类。

我失败的解决方案

我尝试了以下方法来填补代码中的空白:

    AvroCoder.of(SpecificRecordBase.class):不工作

    运行管道时出现以下错误:

Caused by: avro.shaded.com.google.common.util.concurrent.UncheckedExecutionException: org.apache.avro.AvroRuntimeException: Not a Specific class: class org.apache.avro.specific.SpecificRecordBase
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$Segment.get(LocalCache.java:2234)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache.get(LocalCache.java:3965)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache.getOrLoad(LocalCache.java:3969)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$LocalManualCache.get(LocalCache.java:4829)
 at org.apache.avro.specific.SpecificData.getSchema(SpecificData.java:225)
 ... 23 more
Caused by: org.apache.avro.AvroRuntimeException: Not a Specific class: class org.apache.avro.specific.SpecificRecordBase
 at org.apache.avro.specific.SpecificData.createSchema(SpecificData.java:285)
 at org.apache.avro.reflect.ReflectData.createSchema(ReflectData.java:594)
 at org.apache.avro.specific.SpecificData$2.load(SpecificData.java:218)
 at org.apache.avro.specific.SpecificData$2.load(SpecificData.java:215)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$LoadingValueReference.loadFuture(LocalCache.java:3568)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$Segment.loadSync(LocalCache.java:2350)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$Segment.lockedGetOrLoad(LocalCache.java:2313)
 at avro.shaded.com.google.common.cache.LocalCache$Segment.get(LocalCache.java:2228)
 ... 27 more

    SerializableCoder.of(SpecificRecordBase.class):抛出令人困惑的异常

    这应该是一个很有前途的选择,但是当我运行 Pipeline 时,我在下面遇到了非常令人困惑的错误,下面是令人困惑的,因为 Cat 实际上是通过从 SpecificRecordBase 继承来实现可序列化的:

   Caused by: java.lang.ClassCastException: Cat cannot be cast to java.io.Serializable
    at org.apache.beam.sdk.coders.SerializableCoder.encode(SerializableCoder.java:53)
    at org.apache.beam.sdk.coders.Coder.encode(Coder.java:136)
    at org.apache.beam.sdk.util.WindowedValue$FullWindowedValueCoder.encode(WindowedValue.java:578)
    at org.apache.beam.sdk.util.WindowedValue$FullWindowedValueCoder.encode(WindowedValue.java:569)
    at org.apache.beam.sdk.util.WindowedValue$FullWindowedValueCoder.encode(WindowedValue.java:529)
    at org.apache.beam.runners.spark.coders.CoderHelpers.toByteArray(CoderHelpers.java:53)
    at org.apache.beam.runners.spark.coders.CoderHelpers.lambda$toByteFunction$28e77fe8$1(CoderHelpers.java:143)
    at org.apache.spark.api.java.JavaPairRDD$$anonfun$pairFunToScalaFun$1.apply(JavaPairRDD.scala:1043)
    at org.apache.spark.api.java.JavaPairRDD$$anonfun$pairFunToScalaFun$1.apply(JavaPairRDD.scala:1043)
    at scala.collection.Iterator$$anon$11.next(Iterator.scala:409)
    at org.apache.spark.shuffle.sort.BypassMergeSortShuffleWriter.write(BypassMergeSortShuffleWriter.java:149)
    at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:96)
    at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:53)
    at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:109)
    at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:345)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1149)
    at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:624)
    at java.lang.Thread.run(Thread.java:748)
    不要自己安装编码器,让 Beam 推断。 系统会为我推断出合适的编码器。这种无所事事的解决方案在我的独立机器上有效,但是当我将它们放入真正的多服务器环境时,它们只是抛出异常,表明它们无法推断出编码器。
Caused by: java.lang.IllegalStateException: Unable to return a default Coder for ParDo(Deserialize)/ParMultiDo(Deserialize).output [PCollection]. Correct one of the following root causes:
  No Coder has been manually specified;  you may do so using .setCoder().
  Inferring a Coder from the CoderRegistry failed: Cannot provide coder for parameterized type org.apache.beam.sdk.values.KV<java.lang.String, org.apache.avro.specific.SpecificRecordBase>: Unable to provide a Coder for org.apache.avro.specific.SpecificRecordBase.
  Building a Coder using a registered CoderProvider failed.
  See suppressed exceptions for detailed failures.
  Using the default output Coder from the producing PTransform failed: PTransform.getOutputCoder called.
    at org.apache.beam.vendor.guava.v26_0_jre.com.google.common.base.Preconditions.checkState(Preconditions.java:507)
    at org.apache.beam.sdk.values.PCollection.getCoder(PCollection.java:278)
    at org.apache.beam.sdk.values.PCollection.finishSpecifying(PCollection.java:115)
    at org.apache.beam.sdk.runners.TransformHierarchy.finishSpecifyingInput(TransformHierarchy.java:191)
    at org.apache.beam.sdk.Pipeline.applyInternal(Pipeline.java:538)
    at org.apache.beam.sdk.Pipeline.applyTransform(Pipeline.java:473)
    at org.apache.beam.sdk.values.PCollection.apply(PCollection.java:357)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:62)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:498)
    at org.springframework.beans.factory.support.SimpleInstantiationStrategy.instantiate(SimpleInstantiationStrategy.java:154)

【问题讨论】:

【参考方案1】:

我终于使用解决方法解决了此处发布的问题。

根本原因

原来是由于不同环境中的编码器不兼容造成的。虽然编码器在我的本地环境中工作,但 prod 依赖版本不同,使得 Beam 库无法对派生自 SpecificRecordBase 的类进行编码和解码。

两种解决方案

1) 使用字节作为输入和字节作为输出来更改管道中的每个 doFun:

public class GiveShowerToPetDoFn extends DoFn<KV<String, byte[]>, KV<String, byte[]>> 
   ...

这意味着您将在执行实际业务逻辑之前手动将对象从字节反序列化,并将结果序列化回字节作为最后一步。这使得 Beam 在应用的 doFun 之间使用默认字节编码器/解码器,并且编码器/解码器将始终有效,因为它处理的是基本类型而不是自定义类型。

2) 为您的自定义类型编写自己的编码器/解码器。

解决方案 1 和 2 在本质上是相同的。就我而言,我使用第一个解决方案来解决我的问题。

【讨论】:

以上是关于如何为 Apache Beam 中 Avro SpecificRecordBase 的所有子类选择单个编码器?的主要内容,如果未能解决你的问题,请参考以下文章

Apache Beam - 将大查询读取为通用记录(Avro 格式)

使用 Apache Beam 反序列化 Kafka AVRO 消息

Apache-beam Bigquery .fromQuery ClassCastException

Beam - 读取 AVRO 并转换

如何为复杂的 json 文档定义 avro 模式?

如何为具有 30MB+ 数据的大型平面文件生成单个 .avro 文件